RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4_PAR_Y

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y USP44Q9H0E7 712 aa20.27■□□□□ 0.84
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FGFR2P21802 821 aa20.26■□□□□ 0.83
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y INPP5BP32019 993 aa20.26■□□□□ 0.83
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PPATQ06203 517 aa20.26■□□□□ 0.83
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y WDR66Q8TBY9 1149 aa20.26■□□□□ 0.83
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CENPFP49454 3210 aa20.25■□□□□ 0.83
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SSH1Q8WYL5 1049 aa20.25■□□□□ 0.83
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CPA4Q9UI42 421 aa20.25■□□□□ 0.83
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.23■□□□□ 0.83
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SIL1Q9H173 461 aa20.23■□□□□ 0.83
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.23■□□□□ 0.83
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y USP40Q9NVE5 1235 aa20.22■□□□□ 0.83
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NFIAQ12857 509 aa20.21■□□□□ 0.83
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C17orf99Q6UX52 265 aa20.21■□□□□ 0.83
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ANKRD23Q86SG2 305 aa20.21■□□□□ 0.83
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HOXD10P28358 340 aa20.2■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PRDX5P30044 214 aa20.2■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ATP2B3Q16720 1220 aa20.2■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.2■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CEP126Q9P2H0 1117 aa20.2■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.2■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CTGFP29279 349 aa20.19■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MTFR1Q15390 333 aa20.19■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RAET1EQ8TD07 263 aa20.19■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TRIM47Q96LD4 638 aa20.19■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SRRDQ9UH36 339 aa20.19■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF112Q9UJU3 913 aa20.19■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y H0YGN5 161 aa20.18■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y OSBPP22059 807 aa20.18■□□□□ 0.82
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FAM198AQ9UFP1 575 aa20.18■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.18■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BRCA2P51587 3418 aa20.18■□□□□ 0.82
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.17■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CYP2C8P10632 490 aa20.16■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GRK4P32298 578 aa20.16■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DPF3Q92784 378 aa20.16■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.16■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MYPNQ86TC9 1320 aa20.16■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CIAO1O76071 339 aa20.15■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PHKA1P46020 1223 aa20.15■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MOGSQ13724 837 aa20.15■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.15■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PICK1Q9NRD5 415 aa20.15■□□□□ 0.82
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.14■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CXCL11O14625 94 aa20.14■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RGS3P49796 1198 aa20.14■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLFN5Q08AF3 891 aa20.14■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FBXO3Q9UK99 471 aa20.14■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.14■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y AK9Q5TCS8 1911 aa20.14■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SEMA3EO15041 775 aa20.13■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CCL5P13501 91 aa20.13■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FCGRTP55899 365 aa20.13■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PRKCZQ05513 592 aa20.13■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GPAT2Q6NUI2 795 aa20.13■□□□□ 0.81
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.13■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SHISA4Q96DD7 197 aa20.13■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CDCA7LQ96GN5 454 aa20.13■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RNF208Q9H0X6 261 aa20.13■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ABCF2Q9UG63 623 aa20.13■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MYH13Q9UKX3 1938 aa20.13■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SALL1Q9NSC2 1324 aa20.12■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ADORA1P30542 326 aa20.12■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y UBXN2AP68543 259 aa20.12■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CCDC102BQ68D86 513 aa20.12■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GADL1Q6ZQY3 521 aa20.12■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SCYL3Q8IZE3 742 aa20.12■□□□□ 0.81
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
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