RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 CEP126Q9P2H0 1117 aa31.1■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 PPIL2Q13356 520 aa31.09■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 SNAPC2Q13487 334 aa31.09■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 ATP2B3Q16720 1220 aa31.09■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 MIGA2Q7L4E1 593 aa31.09■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF341Q9BYN7 854 aa31.09■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa31.09■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 MYH13Q9UKX3 1938 aa31.08■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 BTBD19C9JJ37 291 aa31.08■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 DIXDC1Q155Q3 683 aa31.08■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa31.08■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 TLR2O60603 784 aa31.07■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 PRDX5P30044 214 aa31.07■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 INPP5BP32019 993 aa31.05■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 IL15P40933 162 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 PPATQ06203 517 aa31.05■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 TCP10Q12799 353 aa31.05■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF112Q9UJU3 913 aa31.05■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 HDAC5Q9UQL6 1122 aa31.05■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 SALL1Q9NSC2 1324 aa31.04■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 LDHBP07195 334 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 NFIAQ12857 509 aa31.04■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF333Q96JL9 665 aa31.04■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa31.04■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA3EO15041 775 aa31.03■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 PHKA1P46020 1223 aa31.03■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 PCDH10Q9P2E7 1040 aa31.03■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 DENND2AQ9ULE3 1009 aa31.03■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB22O15209 634 aa31.02■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 EN2P19622 333 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa31.02■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 COPRSQ9NQ92 184 aa31.02■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 USP40Q9NVE5 1235 aa31.02■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 FAM198AQ9UFP1 575 aa31.02■■■□□ 2.56
PTPRF-216ENST00000617451 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 NBPF11Q86T75 865 aa31.01■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM106CQ9BVX2 250 aa31■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa31■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 KIF22Q14807 665 aa30.99■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 MEIS3Q99687 375 aa30.99■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 KCNH4Q9UQ05 1017 aa30.99■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 ADORA1P30542 326 aa30.98■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC102BQ68D86 513 aa30.98■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD23Q86SG2 305 aa30.98■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 GNRH1P01148 92 aa30.97■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 C17orf99Q6UX52 265 aa30.97■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 ZFPM1Q8IX07 1006 aa30.97■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 AK9Q5TCS8 1911 aa30.96■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 RARSP54136 660 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 MOGSQ13724 837 aa30.95■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 GCC1Q96CN9 775 aa30.95■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 IDI2Q9BXS1 227 aa30.95■■■□□ 2.55
PTPRF-216ENST00000617451 GAKO14976 1311 aa30.95■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 PDHXO00330 501 aa30.94■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 TIMM10P62072 90 aa30.94■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 RASGRF1Q13972 1273 aa30.94■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP45Q92619 1136 aa30.94■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa30.94■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 ATRNL1Q5VV63 1379 aa30.93■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 CPA4Q9UI42 421 aa30.93■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 ENTPD3O75355 529 aa30.92■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 RGS3P49796 1198 aa30.92■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 PRMT2P55345 433 aa30.92■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa30.92■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 SH3TC2Q8TF17 1288 aa30.92■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 ADGRA2Q96PE1 1338 aa30.92■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 PHF20L1A8MW92 1017 aa30.91■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 GNAI3P08754 354 aa30.91■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 MYH2Q9UKX2 1941 aa30.9■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 CXCL11O14625 94 aa30.9■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 SRGAP3O43295 1099 aa30.9■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 CTGFP29279 349 aa30.9■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 MTX1Q13505 466 aa30.9■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 ABCF2Q9UG63 623 aa30.9■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 RFX7Q2KHR2 1363 aa30.9■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GUL7 405 aa30.89■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 PSMC4P43686 418 aa30.89■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 TFCP2Q12800 502 aa30.89■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa30.89■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 SLF2Q8IX21 1173 aa30.89■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 XAGE2Q96GT9 111 aa30.89■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM47Q96LD4 638 aa30.89■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 AKAP2Q9Y2D5 859 aa30.89■■■□□ 2.54
PTPRF-216ENST00000617451 MYCP01106 439 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
PTPRF-216ENST00000617451 MAP3K10Q02779 954 aa30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms