RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598415.5

DEDD2-208, Transcript of death effector domain containing 2, human

TSL 2

Gene DEDD2, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DEDD2-208	ENST00000598415	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		28.02	■■■□□ 2.08
DEDD2-208	ENST00000598415	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		28.02	■■■□□ 2.08
DEDD2-208	ENST00000598415	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		28.02	■■■□□ 2.08
DEDD2-208	ENST00000598415	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		28.02	■■■□□ 2.08
DEDD2-208	ENST00000598415	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		28.02	■■■□□ 2.08
DEDD2-208	ENST00000598415	TNS4	Q8IZW8	715 aa		28.02	■■■□□ 2.08
DEDD2-208	ENST00000598415	OTOF	Q9HC10	1997 aa		28.02	■■■□□ 2.08
DEDD2-208	ENST00000598415	UNCX	A6NJT0	531 aa		28.01	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	SLF2	Q8IX21	1173 aa		28.01	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		28.01	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	GAK	O14976	1311 aa		28	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	HMMR	O75330	724 aa		28	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		28	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	IFFO2	Q5TF58	517 aa		28	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		28	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	USP40	Q9NVE5	1235 aa		28	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		28	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	MECOM	Q03112	1051 aa		27.99	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		27.99	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		27.99	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	SPRYD7	Q5W111	196 aa		27.98	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		27.98	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	RNF186	Q9NXI6	227 aa		27.98	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		27.97	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	FAM151A	Q8WW52	585 aa		27.97	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	TRPA1	O75762	1119 aa		27.96	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	NFIA	Q12857	509 aa		27.96	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	HOOK2	Q96ED9	719 aa		27.96	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	WNK4	Q96J92	1243 aa		27.96	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	SNRK	Q9NRH2	765 aa		27.96	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	RAI14	Q9P0K7	980 aa		27.96	■■■□□ 2.07
DEDD2-208	ENST00000598415	TCP10	Q12799	353 aa		27.95	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		27.95	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	ZNF384	Q8TF68	577 aa		27.95	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	LAMB1	P07942	1786 aa		27.94	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		27.94	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	BTD	P43251	543 aa		27.94	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	TM4SF4	P48230	202 aa		27.94	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	GSTO1	P78417	241 aa		27.94	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	SREBF2	Q12772	1141 aa		27.94	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	AACS	Q86V21	672 aa		27.94	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		27.94	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		27.94	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	AK9	Q5TCS8	1911 aa		27.93	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	27.93	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		27.93	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		27.92	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		27.92	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	LDHC	P07864	332 aa		27.92	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	MAP3K9	P80192	1104 aa		27.92	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	DCAF15	Q66K64	600 aa		27.92	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		27.92	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	IDI2	Q9BXS1	227 aa		27.92	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	ELP3	Q9H9T3	547 aa		27.92	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	APBB1	O00213	710 aa		27.91	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	ZAP70	P43403	619 aa		27.91	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	VGLL4	Q14135	290 aa		27.91	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	CSAD	Q9Y600	493 aa		27.91	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		27.9	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	GJA5	P36382	358 aa		27.9	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	RGS3	P49796	1198 aa		27.9	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	RAB11FIP3	O75154	756 aa		27.89	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	ENTPD3	O75355	529 aa		27.89	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		27.89	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		27.89	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	OPTN	Q96CV9	577 aa		27.89	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	WRNIP1	Q96S55	665 aa		27.89	■■■□□ 2.06
DEDD2-208	ENST00000598415	DOCK2	Q92608	1830 aa		27.88	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	RHBDL3	P58872	404 aa		27.88	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		27.88	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	INHBE	P58166	350 aa		27.87	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	PICALM	Q13492	652 aa		27.86	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	IGSF3	O75054	1194 aa		27.85	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		27.85	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		27.85	■■■□□ 2.05
DEDD2-208	ENST00000598415	TBC1D8	O95759	1140 aa		27.84	■■■□□ 2.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms