RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	GSTO1	P78417	241 aa		21.58	■■□□□ 1.05
ATG13-223	ENST00000577256	PRKG1	Q13976	671 aa		21.58	■■□□□ 1.05
ATG13-223	ENST00000577256	MAP3K11	Q16584	847 aa		21.58	■■□□□ 1.05
ATG13-223	ENST00000577256	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		21.58	■■□□□ 1.05
ATG13-223	ENST00000577256	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		21.58	■■□□□ 1.05
ATG13-223	ENST00000577256	TEPSIN	Q96N21	525 aa		21.58	■■□□□ 1.05
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		21.58	■■□□□ 1.05
ATG13-223	ENST00000577256	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	21.58	■■□□□ 1.05
ATG13-223	ENST00000577256	MECOM	Q03112	1051 aa		21.57	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	SNRK	Q9NRH2	765 aa		21.57	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	RAI14	Q9P0K7	980 aa		21.57	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		21.57	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		21.56	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	UNCX	A6NJT0	531 aa		21.56	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	IGSF3	O75054	1194 aa		21.56	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	LDHC	P07864	332 aa		21.56	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		21.56	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		21.56	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	21.56	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		21.56	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	USP40	Q9NVE5	1235 aa		21.56	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	21.56	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	21.55	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	21.55	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	HOOK2	Q96ED9	719 aa		21.55	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		21.54	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	21.54	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	BTD	P43251	543 aa		21.54	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	ZAP70	P43403	619 aa		21.54	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	CRBN	Q96SW2	442 aa		21.54	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		21.54	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		21.53	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	FOXN1	O15353	648 aa		21.53	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	21.53	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		21.53	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF384	Q8TF68	577 aa		21.53	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	FAM151A	Q8WW52	585 aa		21.53	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	FZD1	Q9UP38	647 aa		21.53	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	21.52	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	21.52	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	21.52	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	21.52	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	ZIC5	Q96T25	663 aa		21.52	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	IDI2	Q9BXS1	227 aa		21.52	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	DCTPP1	Q9H773	170 aa		21.52	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		21.52	■■□□□ 1.04
ATG13-223	ENST00000577256	CA12	O43570	354 aa		21.51	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	NFIA	Q12857	509 aa		21.51	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	21.51	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		21.51	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	21.51	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		21.51	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		21.51	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	AK9	Q5TCS8	1911 aa		21.51	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	ENTPD3	O75355	529 aa		21.5	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	TCP10	Q12799	353 aa		21.5	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	AAMP	Q13685	434 aa		21.5	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	DCAF15	Q66K64	600 aa		21.5	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	BCL11A	Q9H165	835 aa		21.5	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		21.49	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	RGS3	P49796	1198 aa		21.49	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	OTOF	Q9HC10	1997 aa		21.48	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	21.48	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	RHBDL3	P58872	404 aa		21.48	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	21.48	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	21.48	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		21.48	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	DOCK2	Q92608	1830 aa		21.48	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	21.47	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	21.47	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	BAG3	O95817	575 aa		21.47	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	PLCG2	P16885	1265 aa		21.47	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	MAP3K9	P80192	1104 aa		21.47	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	SPRYD7	Q5W111	196 aa		21.47	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	CSRNP1	Q96S65	589 aa		21.47	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	MAP3K12	Q12852	859 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	21.46	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	CSAD	Q9Y600	493 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ATG13-223	ENST00000577256	ATP5J	P18859	108 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ATG13-223	ENST00000577256	PPP4C	P60510	307 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ATG13-223	ENST00000577256	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
ATG13-223	ENST00000577256	PICALM	Q13492	652 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ATG13-223	ENST00000577256	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
ATG13-223	ENST00000577256	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ATG13-223	ENST00000577256	WNK4	Q96J92	1243 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ATG13-223	ENST00000577256	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ATG13-223	ENST00000577256	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ATG13-223	ENST00000577256	LBX1	P52954	281 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ATG13-223	ENST00000577256	SREBF2	Q12772	1141 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ATG13-223	ENST00000577256	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
ATG13-223	ENST00000577256	TEX11	Q8IYF3	940 aa		21.44	■■□□□ 1.02

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