RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
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SPNS2-208ENST00000576635 ADORA1P30542 326 aa19.25■□□□□ 0.67
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SPNS2-208ENST00000576635 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
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SPNS2-208ENST00000576635 SLURP2P0DP57 97 aa19.24■□□□□ 0.67
SPNS2-208ENST00000576635 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa19.24■□□□□ 0.67
SPNS2-208ENST00000576635 SCYL3Q8IZE3 742 aa19.24■□□□□ 0.67
SPNS2-208ENST00000576635 IDI2Q9BXS1 227 aa19.24■□□□□ 0.67
SPNS2-208ENST00000576635 ZHX2Q9Y6X8 837 aa19.24■□□□□ 0.67
SPNS2-208ENST00000576635 GAKO14976 1311 aa19.24■□□□□ 0.67
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