RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536420.5

ACVR1B-204, Transcript of activin A receptor type 1B, humanhuman

TSL 4

Gene ACVR1B, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1B-204ENST00000536420 SIL1Q9H173 461 aa30.01■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 ZNF341Q9BYN7 854 aa30■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 DENND2AQ9ULE3 1009 aa30■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa30■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.99■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 ARHGAP45Q92619 1136 aa29.99■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 COPRSQ9NQ92 184 aa29.99■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 CCER2I3L3R5 266 aa29.98■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 LDHBP07195 334 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 SNAPC2Q13487 334 aa29.98■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 HTTP42858 3142 aa29.97■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 PPIL2Q13356 520 aa29.97■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa29.97■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 PPATQ06203 517 aa29.96■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 FAM43AQ8N2R8 423 aa29.96■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa29.95■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 ARMC5Q96C12 935 aa29.95■■■□□ 2.39
ACVR1B-204ENST00000536420 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 IRF6O14896 467 aa29.94■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 GNAI3P08754 354 aa29.94■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 PRDX5P30044 214 aa29.94■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 TLR2O60603 784 aa29.93■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 DIXDC1Q155Q3 683 aa29.93■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 MIGA2Q7L4E1 593 aa29.93■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 ZNF112Q9UJU3 913 aa29.93■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 MYH2Q9UKX2 1941 aa29.92■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 CENPFP49454 3210 aa29.92■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 MEIS3Q99687 375 aa29.92■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 PHKA1P46020 1223 aa29.91■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 KIF22Q14807 665 aa29.91■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 CCDC102BQ68D86 513 aa29.91■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 NBPF11Q86T75 865 aa29.91■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 SLF2Q8IX21 1173 aa29.91■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 USP40Q9NVE5 1235 aa29.91■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 AKAP2Q9Y2D5 859 aa29.91■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 BTBD19C9JJ37 291 aa29.9■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 GNRH1P01148 92 aa29.9■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 TCP10Q12799 353 aa29.9■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 MTX1Q13505 466 aa29.89■■■□□ 2.38
ACVR1B-204ENST00000536420 INPP5BP32019 993 aa29.88■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 NFIAQ12857 509 aa29.88■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 FAM198AQ9UFP1 575 aa29.88■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 SRGAP3O43295 1099 aa29.87■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 TMEM106CQ9BVX2 250 aa29.87■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 IDI2Q9BXS1 227 aa29.87■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 KCNH4Q9UQ05 1017 aa29.87■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 POTEFA5A3E0 1075 aa29.86■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 ENTPD3O75355 529 aa29.86■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 PRMT2P55345 433 aa29.86■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 TIMM10P62072 90 aa29.86■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 CAP1Q01518 475 aa29.86■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 ANKRD23Q86SG2 305 aa29.86■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa29.85■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 GAKO14976 1311 aa29.85■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 A0A1B0GUL7 405 aa29.84■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 ADORA1P30542 326 aa29.84■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 ZNF333Q96JL9 665 aa29.84■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 DOCK2Q92608 1830 aa29.83■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 RASGRF1Q13972 1273 aa29.83■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 ABCF2Q9UG63 623 aa29.83■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa29.83■■■□□ 2.37
ACVR1B-204ENST00000536420 CXCL11O14625 94 aa29.82■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 RGS3P49796 1198 aa29.82■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 C17orf99Q6UX52 265 aa29.82■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 XAGE2Q96GT9 111 aa29.82■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 TFCP2Q12800 502 aa29.81■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 GCC1Q96CN9 775 aa29.81■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 PDHXO00330 501 aa29.8■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 MAP3K10Q02779 954 aa29.8■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 GNAI2P04899 355 aa29.79■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.79■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 ZFPM1Q8IX07 1006 aa29.79■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 TRIM27P14373 513 aa29.78■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.78■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 NEUROD6Q96NK8 337 aa29.78■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 PCDH10Q9P2E7 1040 aa29.78■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 ATRNL1Q5VV63 1379 aa29.77■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 PHF20L1A8MW92 1017 aa29.77■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 HOXD10P28358 340 aa29.77■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 SCYL3Q8IZE3 742 aa29.77■■■□□ 2.36
ACVR1B-204ENST00000536420 PICK1Q9NRD5 415 aa29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms