RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527168.5

GNPTG-205, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 5

Gene GNPTG, Length 1,317 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-205	ENST00000527168	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	RGMB	Q6NW40	437 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	TEPSIN	Q96N21	525 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	USP40	Q9NVE5	1235 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	GSTO1	P78417	241 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	FZD1	Q9UP38	647 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	AAMP	Q13685	434 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	FAM83A	Q86UY5	434 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	LDHC	P07864	332 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	BTD	P43251	543 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		28.4	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	AOC2	O75106	756 aa		28.4	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	NFIA	Q12857	509 aa		28.4	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		28.4	■■■□□ 2.14
GNPTG-205	ENST00000527168	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	28.39	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	CCDC102A	Q96A19	550 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	TCP10	Q12799	353 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	FAM151A	Q8WW52	585 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	MAP2K2	P36507	400 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	MAP3K11	Q16584	847 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	PCNT	O95613	3336 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	IGSF3	O75054	1194 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	SLC10A3	P09131	477 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	ATP5J	P18859	108 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	RHBDL3	P58872	404 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	NOG	Q13253	232 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	ZIC5	Q96T25	663 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	IDI2	Q9BXS1	227 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	RGS3	P49796	1198 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	GOLIM4	O00461	696 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GNPTG-205	ENST00000527168	MAP3K12	Q12852	859 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	WBP1L	Q9NX94	342 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	ENTPD3	O75355	529 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	CYP7A1	P22680	504 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	HAUS7	Q99871	368 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	28.31	■■■□□ 2.12	3e-6	■■■□□ 14.9
GNPTG-205	ENST00000527168	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	PICALM	Q13492	652 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	GCC1	Q96CN9	775 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	HOOK2	Q96ED9	719 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	BAG3	O95817	575 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	PPP4C	P60510	307 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	DOCK2	Q92608	1830 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	UNCX	A6NJT0	531 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	TEX11	Q8IYF3	940 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	GPATCH3	Q96I76	525 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GNPTG-205	ENST00000527168	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	PLCG2	P16885	1265 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	DCAF15	Q66K64	600 aa		28.26	■■■□□ 2.11

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms