RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CSADQ9Y600 493 aa18.69■□□□□ 0.58
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCAF15Q66K64 600 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.68■□□□□ 0.58
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 ELP3Q9H9T3 547 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPR108Q9NPR9 543 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USP40Q9NVE5 1235 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCF2Q9UG63 623 aa18.67■□□□□ 0.58
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 MS4A4AQ96JQ5 239 aa18.63■□□□□ 0.57
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.63■□□□□ 0.57
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZFPM1Q8IX07 1006 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DBNDD2Q9BQY9 259 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IRF6O14896 467 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 INPP5BP32019 993 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERC1Q8IUD2 1116 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
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