RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ATP9BO43861 1147 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 PDE6BP35913 854 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 FNTAP49354 379 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 SMTNP53814 917 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 CBX3Q13185 183 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 PLCB4Q15147 1175 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 PLPP6Q8IY26 295 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 CFAP45Q9UL16 551 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 MAP3K5Q99683 1374 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 H3BQF6 201 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ZSCAN12O43309 604 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ABL1P00519 1130 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 CCT8P50990 548 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 SPAG5Q96R06 1193 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 IWS1Q96ST2 819 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 FUT8Q9BYC5 575 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 MCM2P49736 904 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 NBPF14Q5TI25 921 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 NEUROD6Q96NK8 337 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 TRPC6Q9Y210 931 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 BCRP11274 1271 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGAP25P42331 645 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 OXCT1P55809 520 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ITIH3Q06033 890 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 CNNM3Q8NE01 707 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 KIF15Q9NS87 1388 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 FAM25EA8MYX2 175 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 MYO1FO00160 1098 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 NDUFB5O43674 189 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 SMIM24O75264 130 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 STAM2O75886 525 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 INAQ16352 499 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 DCLK2Q8N568 766 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 HVCN1Q96D96 273 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 GALNT8Q9NY28 637 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 DKK3Q9UBP4 350 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 TMCC1O94876 653 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF131P52739 623 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 APOBRQ0VD83 1088 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC121Q6ZUS5 278 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 FAM71BQ8TC56 605 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 MAML3Q96JK9 1138 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 NACAP1Q9BZK3 213 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 MAFFQ9ULX9 164 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 KIF11P52732 1056 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 WTAPQ15007 396 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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