RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 BCL11AQ9H165 835 aa30.62■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 PRDM10Q9NQV6 1147 aa30.62■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 MYH2Q9UKX2 1941 aa30.62■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 AKAP11Q9UKA4 1901 aa30.61■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 SNRKQ9NRH2 765 aa30.61■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 FZD1Q9UP38 647 aa30.6■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa30.6■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 CACNB3P54284 484 aa30.59■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa30.59■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.59■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM39BQ9GZU3 492 aa30.58■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa30.58■■■□□ 2.49
CXCL3-202ENST00000502974 MAP3K11Q16584 847 aa30.57■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 LDLRAD1Q5T700 205 aa30.57■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 TSKSQ9UJT2 592 aa30.57■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 IREB2P48200 963 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 TNS4Q8IZW8 715 aa30.56■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 MECOMQ03112 1051 aa30.55■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 FKBP1CQ5VVH2 108 aa30.55■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 SLF2Q8IX21 1173 aa30.55■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 TEPSINQ96N21 525 aa30.55■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 RAI14Q9P0K7 980 aa30.55■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 ZAP70P43403 619 aa30.54■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 FAM83AQ86UY5 434 aa30.54■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 LRRCC1Q9C099 1032 aa30.54■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 LRP2BPQ9P2M1 347 aa30.54■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa30.53■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 CDAN1Q8IWY9 1227 aa30.53■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 CSRNP1Q96S65 589 aa30.53■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 GAKO14976 1311 aa30.52■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 SLC10A4Q96EP9 437 aa30.52■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 DCTPP1Q9H773 170 aa30.52■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 MAST2Q6P0Q8 1798 aa30.51■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa30.51■■■□□ 2.48
CXCL3-202ENST00000502974 UNCXA6NJT0 531 aa30.51■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 USP2O75604 605 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 IFFO2Q5TF58 517 aa30.51■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 USP40Q9NVE5 1235 aa30.51■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 GSTO1P78417 241 aa30.5■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF384Q8TF68 577 aa30.5■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 HOOK2Q96ED9 719 aa30.5■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 CLMNQ96JQ2 1002 aa30.5■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 SAGE1Q9NXZ1 904 aa30.5■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 OTOFQ9HC10 1997 aa30.5■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 AK9Q5TCS8 1911 aa30.49■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 BTDP43251 543 aa30.49■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 SPRYD7Q5W111 196 aa30.49■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa30.49■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa30.49■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 RNF186Q9NXI6 227 aa30.48■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 TRPA1O75762 1119 aa30.47■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 LDHCP07864 332 aa30.47■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 SREBF2Q12772 1141 aa30.47■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 FAM151AQ8WW52 585 aa30.47■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 TCP10Q12799 353 aa30.46■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 NFIAQ12857 509 aa30.45■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 EXOC6Q8TAG9 804 aa30.45■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 WNK4Q96J92 1243 aa30.45■■■□□ 2.47
CXCL3-202ENST00000502974 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa30.44■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 DCAF15Q66K64 600 aa30.44■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 DOCK2Q92608 1830 aa30.44■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa30.44■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 IDH1O75874 414 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 AAMPQ13685 434 aa30.43■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 ANTXR1Q9H6X2 564 aa30.43■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 FAM198AQ9UFP1 575 aa30.43■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 CSADQ9Y600 493 aa30.43■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 TM4SF4P48230 202 aa30.42■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 MAP3K9P80192 1104 aa30.42■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP30.42■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 ELP3Q9H9T3 547 aa30.42■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP30.41■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 RGS3P49796 1198 aa30.4■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 VGLL4Q14135 290 aa30.4■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 WRNIP1Q96S55 665 aa30.4■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 IDI2Q9BXS1 227 aa30.4■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 RFX7Q2KHR2 1363 aa30.4■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 IGSF3O75054 1194 aa30.39■■■□□ 2.46
CXCL3-202ENST00000502974 RHBDL3P58872 404 aa30.39■■■□□ 2.46
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