RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GPR108Q9NPR9 543 aa14.87□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.86□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LBX1P52954 281 aa14.86□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.86□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.86□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.86□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HMMRO75330 724 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TCP10Q12799 353 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AACSQ86V21 672 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TEPSINQ96N21 525 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 USP40Q9NVE5 1235 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MECOMQ03112 1051 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RAI14Q9P0K7 980 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZBTB22O15209 634 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NFIAQ12857 509 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AK9Q5TCS8 1911 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.82□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OTOFQ9HC10 1997 aa14.82□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZAP70P43403 619 aa14.82□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM83AQ86UY5 434 aa14.82□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLF2Q8IX21 1173 aa14.82□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF384Q8TF68 577 aa14.82□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.82□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CSRNP1Q96S65 589 aa14.82□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa14.82□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa14.82□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GAKO14976 1311 aa14.82□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 BTDP43251 543 aa14.81□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAP3K11Q16584 847 aa14.81□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.81□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.81□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.81□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RAB11FIP3O75154 756 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRPA1O75762 1119 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GSTO1P78417 241 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PICALMQ13492 652 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPRYD7Q5W111 196 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TNS4Q8IZW8 715 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM151AQ8WW52 585 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 WNK4Q96J92 1243 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CRBNQ96SW2 442 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ELP3Q9H9T3 547 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RNF186Q9NXI6 227 aa14.8□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CA12O43570 354 aa14.79□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LDHCP07864 332 aa14.79□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RGS3P49796 1198 aa14.79□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.79□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GJA5P36382 358 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAP3K9P80192 1104 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VGLL4Q14135 290 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 WRNIP1Q96S55 665 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RAB30-AS1-201ENST00000501011 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IDH1O75874 414 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RHBDL3P58872 404 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DCAF15Q66K64 600 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OPTNQ96CV9 577 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HOOK2Q96ED9 719 aa14.77□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms