RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496153.5

BUD23-218, Transcript of BUD23, rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor, humanhuman

TSL 4

Gene BUD23, Length 505 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23-218ENST00000496153 RGMBQ6NW40 437 aa22.82■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 FAM83AQ86UY5 434 aa22.82■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 HOOK2Q96ED9 719 aa22.82■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 ZAP70P43403 619 aa22.81■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 USP40Q9NVE5 1235 aa22.81■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 CACNB3P54284 484 aa22.8■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.8■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 CCDC102AQ96A19 550 aa22.8■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 GPATCH3Q96I76 525 aa22.8■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 BTDP43251 543 aa22.79■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.79■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 NOGQ13253 232 aa22.78■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 PRKG1Q13976 671 aa22.78■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.77■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.77■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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BUD23-218ENST00000496153 MAP2K2P36507 400 aa22.77■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 MAP3K12Q12852 859 aa22.77■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 GCC1Q96CN9 775 aa22.77■■□□□ 1.24
BUD23-218ENST00000496153 UNCXA6NJT0 531 aa22.76■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.76■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 BAG3O95817 575 aa22.76■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 PLCG2P16885 1265 aa22.76■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 MOB2Q70IA6 237 aa22.76■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 FAM151AQ8WW52 585 aa22.76■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 TEPSINQ96N21 525 aa22.76■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 ATP5JP18859 108 aa22.75■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 MAP3K11Q16584 847 aa22.75■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.75■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 AIDAQ96BJ3 306 aa22.75■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.75■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 IDI2Q9BXS1 227 aa22.75■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 MYH7P12883 1935 aa22.74■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 OTOFQ9HC10 1997 aa22.74■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 SLC10A3P09131 477 aa22.74■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 TCP10Q12799 353 aa22.74■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 DCAF15Q66K64 600 aa22.74■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 CERS3Q8IU89 383 aa22.74■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 ZNF384Q8TF68 577 aa22.74■■□□□ 1.23
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BUD23-218ENST00000496153 NFIAQ12857 509 aa22.73■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.73■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.73■■□□□ 1.23
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BUD23-218ENST00000496153 AOC2O75106 756 aa22.72■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 RGS3P49796 1198 aa22.72■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.72■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.72■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.72■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.72■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.72■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.72■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 GOLIM4O00461 696 aa22.71■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 CYP7A1P22680 504 aa22.71■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 PICALMQ13492 652 aa22.71■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.71■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.71■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 HAUS7Q99871 368 aa22.71■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.71■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.71■■□□□ 1.23
BUD23-218ENST00000496153 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
BUD23-218ENST00000496153 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
BUD23-218ENST00000496153 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
BUD23-218ENST00000496153 RHBDL3P58872 404 aa22.7■■□□□ 1.22
BUD23-218ENST00000496153 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
BUD23-218ENST00000496153 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.7■■□□□ 1.22
BUD23-218ENST00000496153 TEX11Q8IYF3 940 aa22.7■■□□□ 1.22
BUD23-218ENST00000496153 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
BUD23-218ENST00000496153 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.226e-7■■■□□ 17.3
BUD23-218ENST00000496153 FZD1Q9UP38 647 aa22.7■■□□□ 1.22
BUD23-218ENST00000496153 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.69■■□□□ 1.22
BUD23-218ENST00000496153 ERC2O15083 957 aa22.69■■□□□ 1.22
BUD23-218ENST00000496153 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
BUD23-218ENST00000496153 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.69■■□□□ 1.22
BUD23-218ENST00000496153 CSADQ9Y600 493 aa22.69■■□□□ 1.22
BUD23-218ENST00000496153 PPP4CP60510 307 aa22.68■■□□□ 1.22
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