RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, human

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SZRD1-208	ENST00000476423	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	OTOF	Q9HC10	1997 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A1B0GUL6	1792 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	SMIM22	K7EJ46	135 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	CHL1	O00533	1208 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	BMP1	P13497	986 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF576	Q9H609	170 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	ST18	O60284	1047 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	WRNIP1	Q96S55	665 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	PIEZO1	Q92508	2521 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	MYH3	P11055	1940 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	PRR33	A8MZF0	331 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	NHLH1	Q02575	133 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	DCAF15	Q66K64	600 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	TEPSIN	Q96N21	525 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	MBIP	Q9NS73	344 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	CXCL11	O14625	94 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	PDE8A	O60658	829 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	CACNA1A	O00555	2505 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SZRD1-208	ENST00000476423	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423		F8W031	263 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	CYP2C8	P10632	490 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	DNAJB2	P25686	324 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	MYD88	Q99836	296 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	CD209	Q9NNX6	404 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	HOXB7	P09629	217 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	KLRK1	P26718	216 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	IGFBP4	P22692	258 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	RUNDC1	Q96C34	613 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	TIFA	Q96CG3	184 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF853	P0CG23	659 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	KCNJ4	P48050	445 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	GOLGA2	Q08379	1002 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	RALBP1	Q15311	655 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	CERS5	Q8N5B7	392 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	BAD	Q92934	168 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	HYPK	Q9NX55	129 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SZRD1-208	ENST00000476423	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8

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