RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.22■■□□□ 1.47
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HOOK2Q96ED9 719 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BCL11AQ9H165 835 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP40Q9NVE5 1235 aa24.21■■□□□ 1.47
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCTPP1Q9H773 170 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNF186Q9NXI6 227 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RHBDL3P58872 404 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OPTNQ96CV9 577 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
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