RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.08■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 USP40Q9NVE5 1235 aa25.08■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SCAF8-204ENST00000461219 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.08■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 LDHCP07864 332 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 HOOK2Q96ED9 719 aa25.06■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 SLC10A3P09131 477 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 MECOMQ03112 1051 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 FAM83AQ86UY5 434 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 WBP1LQ9NX94 342 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 FZD1Q9UP38 647 aa25.05■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 TCP10Q12799 353 aa25.04■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.04■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.04■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 BTDP43251 543 aa25.03■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.03■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.02■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 OTOFQ9HC10 1997 aa25.02■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 FOXN1O15353 648 aa25.02■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 ZAP70P43403 619 aa25.02■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 CRBNQ96SW2 442 aa25.02■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.02■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 DOCK2Q92608 1830 aa25.02■■□□□ 1.6
SCAF8-204ENST00000461219 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 DCAF15Q66K64 600 aa25.01■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 GAKO14976 1311 aa25.01■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 FAM151AQ8WW52 585 aa25■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 TEPSINQ96N21 525 aa25■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 CA12O43570 354 aa24.99■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 MAP3K11Q16584 847 aa24.99■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 CSADQ9Y600 493 aa24.99■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 BAG3O95817 575 aa24.98■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 PICALMQ13492 652 aa24.98■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.98■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.98■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 ZIC5Q96T25 663 aa24.98■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.97■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 UNCXA6NJT0 531 aa24.97■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 RGS3P49796 1198 aa24.97■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 NFIAQ12857 509 aa24.97■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 MAP3K12Q12852 859 aa24.96■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.96■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SCAF8-204ENST00000461219 IGSF3O75054 1194 aa24.95■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 ENTPD3O75355 529 aa24.95■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 PLCG2P16885 1265 aa24.95■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 LBX1P52954 281 aa24.95■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 SREBF2Q12772 1141 aa24.95■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.95■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.95■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 MAP3K9P80192 1104 aa24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 TEX11Q8IYF3 940 aa24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 GPATCH3Q96I76 525 aa24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 WRNIP1Q96S55 665 aa24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 IDI2Q9BXS1 227 aa24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 DCTPP1Q9H773 170 aa24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 ELP3Q9H9T3 547 aa24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 TSKSQ9UJT2 592 aa24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 MYH7P12883 1935 aa24.94■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 SPRYD7Q5W111 196 aa24.93■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 WNK4Q96J92 1243 aa24.93■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 CSRNP1Q96S65 589 aa24.93■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.93■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 CYP7A1P22680 504 aa24.92■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.92■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF384Q8TF68 577 aa24.92■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 FOCADQ5VW36 1801 aa24.91■■□□□ 1.58
SCAF8-204ENST00000461219 TRPA1O75762 1119 aa24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms