RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451506.5

PTPRN-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 466 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-209ENST00000451506 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.42■■□□□ 1.02
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PTPRN-209ENST00000451506 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.41■■□□□ 1.02
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PTPRN-209ENST00000451506 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRN-209ENST00000451506 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRN-209ENST00000451506 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
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PTPRN-209ENST00000451506 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.29■■□□□ 1
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PTPRN-209ENST00000451506 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
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