RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	PRDX5	P30044	214 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	RASA3	Q14644	834 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	MYH7	P12883	1935 aa		13.43	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	MECOM	Q03112	1051 aa		13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	WBP1L	Q9NX94	342 aa		13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	BAG3	O95817	575 aa		13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.42	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	PPP4C	P60510	307 aa		13.41	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.41	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.41	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.41	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	GCC1	Q96CN9	775 aa		13.41	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.41	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	ATP5J	P18859	108 aa		13.4	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	BTD	P43251	543 aa		13.4	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	SREBF2	Q12772	1141 aa		13.4	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.4	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	INHBE	P58166	350 aa		13.4	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	MAP3K12	Q12852	859 aa		13.4	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.4	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.4	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.4	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	AOX1	Q06278	1338 aa		13.39	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	ZAP70	P43403	619 aa		13.39	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.39	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	TBC1D12	O60347	775 aa		13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.38	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	TM4SF4	P48230	202 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	SPRYD7	Q5W111	196 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	WNK4	Q96J92	1243 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	HAUS7	Q99871	368 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.37	□□□□□ -0.27	5e-6	■□□□□ 10.6
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	AOC2	O75106	756 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	RHBDL3	P58872	404 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.36	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.36	□□□□□ -0.27

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