RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 CETPP11597 493 aa20.69■□□□□ 0.9
VARS-216ENST00000428445 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.69■□□□□ 0.9
VARS-216ENST00000428445 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
VARS-216ENST00000428445 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.69■□□□□ 0.9
VARS-216ENST00000428445 ZNF333Q96JL9 665 aa20.69■□□□□ 0.9
VARS-216ENST00000428445 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.69■□□□□ 0.9
VARS-216ENST00000428445 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
VARS-216ENST00000428445 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.69■□□□□ 0.9
VARS-216ENST00000428445 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
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VARS-216ENST00000428445 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.68■□□□□ 0.9
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VARS-216ENST00000428445 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
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VARS-216ENST00000428445 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.64■□□□□ 0.89
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VARS-216ENST00000428445 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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VARS-216ENST00000428445 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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VARS-216ENST00000428445 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
VARS-216ENST00000428445 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.58■□□□□ 0.89
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VARS-216ENST00000428445 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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VARS-216ENST00000428445 PICALMQ13492 652 aa20.56■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 SRRDQ9UH36 339 aa20.56■□□□□ 0.88
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VARS-216ENST00000428445 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.56■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 XAGE2Q96GT9 111 aa20.55■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 GABRQQ9UN88 632 aa20.55■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 DOCK2Q92608 1830 aa20.55■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 GAKO14976 1311 aa20.54■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 A0A1B0GUL7 405 aa20.54■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 SEMA3EO15041 775 aa20.54■□□□□ 0.88
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