RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTFR1Q15390 333 aa16.39■□□□□ 0.21
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYPNQ86TC9 1320 aa16.39■□□□□ 0.21
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGS3P49796 1198 aa16.38■□□□□ 0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAET1EQ8TD07 263 aa16.38■□□□□ 0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.38■□□□□ 0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IDI2Q9BXS1 227 aa16.38■□□□□ 0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAKO14976 1311 aa16.38■□□□□ 0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENTPD3O75355 529 aa16.37■□□□□ 0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCRP11274 1271 aa16.37■□□□□ 0.21
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