RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 CETPP11597 493 aa31.19■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 PRDX5P30044 214 aa31.19■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF341Q9BYN7 854 aa31.19■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa31.19■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 LDHBP07195 334 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 CAP1Q01518 475 aa31.18■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 TCP10Q12799 353 aa31.18■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 HDAC5Q9UQL6 1122 aa31.18■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 POTEFA5A3E0 1075 aa31.17■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 IRF6O14896 467 aa31.17■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 SNAPC2Q13487 334 aa31.17■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM151AQ8WW52 585 aa31.17■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 MYH2Q9UKX2 1941 aa31.17■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 CENPFP49454 3210 aa31.16■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 IL15P40933 162 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGEF6Q15052 776 aa31.16■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa31.16■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 PHKA1P46020 1223 aa31.15■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 PPIL2Q13356 520 aa31.15■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 MEIS3Q99687 375 aa31.15■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 DENND2AQ9ULE3 1009 aa31.15■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa31.14■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 BTBD19C9JJ37 291 aa31.14■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 INPP5BP32019 993 aa31.14■■■□□ 2.58
PPP4R4-202ENST00000328839 NFIAQ12857 509 aa31.13■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 ARMC5Q96C12 935 aa31.13■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 USP40Q9NVE5 1235 aa31.13■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 ADORA1P30542 326 aa31.12■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 DOCK2Q92608 1830 aa31.12■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 SEMA3EO15041 775 aa31.11■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 PPATQ06203 517 aa31.11■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 COPRSQ9NQ92 184 aa31.11■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 SALL1Q9NSC2 1324 aa31.11■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa31.11■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 TLR2O60603 784 aa31.1■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 KIF22Q14807 665 aa31.1■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa31.1■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 RARSP54136 660 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC102BQ68D86 513 aa31.09■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM198AQ9UFP1 575 aa31.09■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM106CQ9BVX2 250 aa31.08■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa31.08■■■□□ 2.57
PPP4R4-202ENST00000328839 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 TIMM10P62072 90 aa31.07■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 NBPF11Q86T75 865 aa31.07■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 ABCF2Q9UG63 623 aa31.07■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 SRGAP3O43295 1099 aa31.06■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 GNAI3P08754 354 aa31.06■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 EN2P19622 333 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF112Q9UJU3 913 aa31.06■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 RASGRF1Q13972 1273 aa31.05■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 ZFPM1Q8IX07 1006 aa31.05■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF333Q96JL9 665 aa31.05■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 MYCP01106 439 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGAP45Q92619 1136 aa31.04■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 CCER2I3L3R5 266 aa31.03■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 RGS3P49796 1198 aa31.03■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 TFCP2Q12800 502 aa31.03■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 ANKRD23Q86SG2 305 aa31.03■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 CPA4Q9UI42 421 aa31.03■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 A0A1B0GUL7 405 aa31.02■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 PDHXO00330 501 aa31.02■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa31.02■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 KCNH4Q9UQ05 1017 aa31.02■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 AKAP2Q9Y2D5 859 aa31.02■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 BRCA2P51587 3418 aa31.01■■■□□ 2.56
PPP4R4-202ENST00000328839 SLF2Q8IX21 1173 aa31.01■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 XAGE2Q96GT9 111 aa31.01■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 GAKO14976 1311 aa31■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 MVPQ14764 893 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 SH3TC2Q8TF17 1288 aa31■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 NEUROD6Q96NK8 337 aa31■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 IDI2Q9BXS1 227 aa31■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 ENTPD3O75355 529 aa30.99■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 PICALMQ13492 652 aa30.99■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 C17orf99Q6UX52 265 aa30.99■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 GNRH1P01148 92 aa30.98■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 BTDP43251 543 aa30.98■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 PICK1Q9NRD5 415 aa30.98■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 DOCK1Q14185 1865 aa30.97■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 ATRNL1Q5VV63 1379 aa30.97■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 ZBTB22O15209 634 aa30.97■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 MTX1Q13505 466 aa30.97■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 GORABQ5T7V8 394 aa30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms