RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 PRKAB2O43741 272 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 CDKL5O76039 1030 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 CAVIN2O95810 425 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 TPM3P06753 285 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 ALG1Q9BT22 464 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 BCORQ6W2J9 1755 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 ZBTB43O43298 467 aa22.39■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 YEATS4O95619 227 aa22.39■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 BARGINQ6ZT62 677 aa22.39■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 LCORLQ8N3X6 602 aa22.39■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 TRIM5Q9C035 493 aa22.39■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.39■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.39■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 A0A1B0GVL5 298 aa22.39■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.39■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 MYL10Q9BUA6 226 aa22.39■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.39■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 A0A1W2PQ27 194 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 A0A1W2PQ64 194 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 A0A1W2PQD8 194 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 SPTLC2O15270 562 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 ZNF75DP51815 510 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 PHKBQ93100 1093 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 TDO2P48775 406 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
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USP21-201ENST00000289865 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.37■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.37■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.37■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.37■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 A0A087WWV3 80 aa22.36■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 GNAT2P19087 354 aa22.36■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 ERFEQ4G0M1 354 aa22.36■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 ANO1Q5XXA6 986 aa22.36■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.36■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.36■■□□□ 1.17
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USP21-201ENST00000289865 KRT40Q6A162 431 aa22.36■■□□□ 1.17
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USP21-201ENST00000289865 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.36■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 RGS22Q8NE09 1264 aa22.36■■□□□ 1.17
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USP21-201ENST00000289865 KRT23Q9C075 422 aa22.36■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.36■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 TAF1P21675 1872 aa22.35■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.35■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 LIFRP42702 1097 aa22.35■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.35■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.35■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.35■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 CCDC69A6NI79 296 aa22.35■■□□□ 1.17
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USP21-201ENST00000289865 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
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USP21-201ENST00000289865 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.35■■□□□ 1.17
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USP21-201ENST00000289865 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.35■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.35■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 SDF4Q9BRK5 362 aa22.35■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 TOMM22Q9NS69 142 aa22.35■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.35■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.34■■□□□ 1.17
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USP21-201ENST00000289865 A0A1B0GUL6 1792 aa22.34■■□□□ 1.17
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USP21-201ENST00000289865 CYP7A1P22680 504 aa22.33■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 KCNQ4P56696 695 aa22.33■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.33■■□□□ 1.17
USP21-201ENST00000289865 GYG1P46976 350 aa22.33■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.33■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 ABCF2Q9UG63 623 aa22.33■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 FBXW7Q969H0 707 aa22.32■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.32■■□□□ 1.16
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