RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263054.10

SORCS1-201, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SORCS1, Length 7,272 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-201ENST00000263054 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 TTC36A6NLP5 189 aa16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 EHBP1Q8NDI1 1231 aa16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 MYL10Q9BUA6 226 aa16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 PRDM1O75626 825 aa16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 SLU7O95391 586 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 PSMD6Q15008 389 aa16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 RDH13Q8NBN7 331 aa16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 PSMB7Q99436 277 aa16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 PAGR1Q9BTK6 254 aa16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 HSPA4P34932 840 aa16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 STRN3Q13033 797 aa16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 LARGE2Q8N3Y3 721 aa16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 RRP9O43818 475 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 TRIM7Q9C029 511 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 NEMFO60524 1076 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 SEPT14Q6ZU15 432 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 TRIM31Q9BZY9 425 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 ATP2A1O14983 1001 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 CALML3P27482 149 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 GPR162Q16538 588 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 CASC4Q6P4E1 433 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 STX10O60499 249 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 SATB1Q01826 763 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 BEND3Q5T5X7 828 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 DYMQ7RTS9 669 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 IGSF3O75054 1194 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 ARFGAP3Q9NP61 516 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 ANAPC4Q9UJX5 808 aa16.16■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 H0YIN7 160 aa16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 HPDP32754 393 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 SV2BQ7L1I2 683 aa16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 EYA3Q99504 573 aa16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 HSPA1LP34931 641 aa16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 DAAM2Q86T65 1068 aa16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 SMC6Q96SB8 1091 aa16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 CUL7Q14999 1698 aa16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 GNA11P29992 359 aa16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 SPOPO43791 374 aa16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 F13A1P00488 732 aa16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 CCDC14Q49A88 953 aa16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 APBA3O96018 575 aa16.14■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 RUFY3Q7L099 469 aa16.14■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 STK32BQ9NY57 414 aa16.14■□□□□ 0.18
SORCS1-201ENST00000263054 BICDL2A1A5D9 508 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 GCNT3O95395 438 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 PLCG2P16885 1265 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 TYRO3Q06418 890 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 PTPROQ16827 1216 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 PDE4DQ08499 809 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 LRMPQ12912 555 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 BSPRYQ5W0U4 402 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 ABCC1P33527 1531 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 GNAT2P19087 354 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 SYT10Q6XYQ8 523 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 ANKS4BQ8N8V4 417 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 PHKBQ93100 1093 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 CFAP57Q96MR6 1250 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 CEP57Q86XR8 500 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 MYO1AQ9UBC5 1043 aa16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 CFBP00751 764 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 GADL1Q6ZQY3 521 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 IFT74Q96LB3 600 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 GGA1Q9UJY5 639 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 PRXQ9BXM0 1461 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 ATP8B2P98198 1209 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 MSANTD4Q8NCY6 345 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 FAM200AQ8TCP9 573 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 GOLGA1Q92805 767 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 CPLX4Q7Z7G2 160 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 TBC1D32Q96NH3 1257 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 A0A1B0GUL7 405 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 A1BGP04217 495 aa16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SORCS1-201ENST00000263054 LMBR1Q8WVP7 490 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms