RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262643.7

CCNE1-201, Transcript of cyclin E1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNE1, Length 2,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1-201ENST00000262643 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.01■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.01■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.01■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 KIF1BPQ96EK5 621 aa26■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.99■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 CCDC102AQ96A19 550 aa25.99■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 MAP2K2P36507 400 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 MECOMQ03112 1051 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 SMC5Q8IY18 1101 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 ZIC5Q96T25 663 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 RAB11FIP3O75154 756 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 NOGQ13253 232 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 WBP1LQ9NX94 342 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 RAI14Q9P0K7 980 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 SLF2Q8IX21 1173 aa25.97■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 AIDAQ96BJ3 306 aa25.97■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 TEPSINQ96N21 525 aa25.97■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 USP40Q9NVE5 1235 aa25.97■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 ZAP70P43403 619 aa25.96■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 SLC10A3P09131 477 aa25.95■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.95■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 ZNF384Q8TF68 577 aa25.95■■□□□ 1.75
CCNE1-201ENST00000262643 GAKO14976 1311 aa25.95■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 FOXN1O15353 648 aa25.95■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.95■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 TCP10Q12799 353 aa25.94■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 FAM83AQ86UY5 434 aa25.94■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.94■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.94■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 BTDP43251 543 aa25.93■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 NFIAQ12857 509 aa25.93■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.93■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 GSTO1P78417 241 aa25.92■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.92■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 MAP3K11Q16584 847 aa25.92■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 AK9Q5TCS8 1911 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 LDHCP07864 332 aa25.9■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.9■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 FAM151AQ8WW52 585 aa25.9■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 GCC1Q96CN9 775 aa25.9■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.9■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.89■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 NUCB1Q02818 461 aa25.89■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 DCTPP1Q9H773 170 aa25.89■■□□□ 1.74
CCNE1-201ENST00000262643 PDE4AP27815 886 aa25.88■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.88■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.88■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 PICALMQ13492 652 aa25.87■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.87■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.87■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 TSKSQ9UJT2 592 aa25.87■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.87■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 IDI2Q9BXS1 227 aa25.87■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 RHBDL3P58872 404 aa25.86■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.86■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 HOOK2Q96ED9 719 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 CSRNP1Q96S65 589 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 LNPKQ9C0E8 428 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 OTOFQ9HC10 1997 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 LBX1P52954 281 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.84■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 BACH2Q9BYV9 841 aa25.84■■□□□ 1.73
CCNE1-201ENST00000262643 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms