RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	HYPM	O75409	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	EDN2	P20800	178 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	FHL3	Q13643	280 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	GPHB5	Q86YW7	130 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	RGS13	O14921	159 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	MB	P02144	154 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM78B	Q5VT40	261 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	RNF141	Q8WVD5	230 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	CCL24	O00175	119 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	SYNJ2BP	P57105	145 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	LEMD1	Q68G75	181 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	RAB5C	P51148	216 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	TM4SF20	Q53R12	229 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	DPF1	Q92782	380 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	RAB24	Q969Q5	203 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	PFDN5	Q99471	154 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	ZP3	P21754	424 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	RABAC1	Q9UI14	185 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	FUT9	Q9Y231	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	NMB	P08949	121 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	RHOB	P62745	196 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421		H3BRN7	92 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	CRYBB3	P26998	211 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	REC114	Q7Z4M0	266 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-238	ENST00000640421	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421		A0A1B0GV50	99 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421		A0A1W2PPV4	95 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	LCN15	Q6UWW0	184 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	C1QL4	Q86Z23	238 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF98	A6NK75	572 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421		A8MWP6	167 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	LGALS9	O00182	355 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF503	Q96F45	646 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	METTL26	Q96S19	204 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421		U3KQE9	123 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	NPPC	P23582	126 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF747	Q9BV97	191 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	BUB3	O43684	328 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	STAG3L2	P0CL84	134 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	STAG3L3	P0CL85	134 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	RNF2	Q99496	336 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421		K7EMT4	169 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	C8orf88	P0DMB2	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	CCL20	P78556	96 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	PYY	P10082	97 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	C3orf56	Q8N813	242 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-238	ENST00000640421	C2orf70	A6NJV1	201 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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