RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 MTFP1Q9UDX5 166 aa19.21■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V1G2O95670 118 aa19.2■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 INSP01308 110 aa19.2■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 PRM2P04554 102 aa19.2■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 SULT1A3P0DMM9 295 aa19.2■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 SULT1A4P0DMN0 295 aa19.2■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 NCS1P62166 190 aa19.2■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 CLINT1Q14677 625 aa19.2■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMD13Q5VXD3 122 aa19.2■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 LGI3Q8N145 548 aa19.2■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 C20orf173Q96LM9 149 aa19.2■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 CACFD1Q9UGQ2 172 aa19.2■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 U3KQ87 197 aa19.2■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 GABARAPH6UMI1 98 aa19.19■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 GABARAPO95166 117 aa19.19■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R19P59542 299 aa19.19■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4C16Q8NGL9 310 aa19.19■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRPGP15A8MWD9 76 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 MEOX2P50222 304 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 VBP1P61758 197 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 STEAP1BQ6NZ63 245 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 MZT2AQ6P582 158 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM229BQ8NBD8 167 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 DTD1Q8TEA8 209 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 EXTL2Q9UBQ6 330 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00588Q9Y4M8 146 aa19.18■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 HERC1Q15751 4861 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R2Z0 102 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 GALR1P47211 349 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 GAMTQ14353 236 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 SPINK13Q1W4C9 94 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 FAAP20Q6NZ36 180 aa19.17■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP5G1P05496 136 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP5G3P48201 142 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 FCN2Q15485 313 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR107Q5VW38 600 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 AMTNQ6UX39 209 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A22Q9H936 323 aa19.16■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 RBKSQ9H477 322 aa19.15■□□□□ 0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 CNN1P51911 297 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 BAP18Q8IXM2 172 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 OR11H7Q8NGC8 314 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF141Q8WVD5 230 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 RSG1Q9BU20 258 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR13Q9NZ81 148 aa19.14■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 SSX7Q7RTT5 188 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A32Q9H2D1 315 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MTW9 85 aa19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 DISC1C4P0D8 188 aa19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 B2MP61769 119 aa19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPB7Q9UBY9 170 aa19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
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CAPNS1-217ENST00000629983 SMCO1Q147U7 214 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC32Q5I0X7 151 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 C15orf40Q8WUR7 153 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 AP3S1Q92572 193 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 FUNDC2Q9BWH2 189 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 Q9H8V8 135 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 CBY3A6NI87 242 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 CRXO43186 299 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 AZU1P20160 251 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPOP30536 169 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR141Q7Z602 305 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 IL22RA2Q969J5 263 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 TRGV9Q99603 122 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa19.09■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 HTN1P15515 57 aa19.09■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP10-2P60368 255 aa19.09■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 FGL1Q08830 312 aa19.09■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 IGFL4Q6B9Z1 124 aa19.09■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01587Q99440 93 aa19.09■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa19.09■□□□□ 0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 DLK1P80370 383 aa19.08■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa19.08■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1S1Q8NH92 325 aa19.08■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR132Q9UNW8 380 aa19.08■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 PLAC8L1A1L4L8 177 aa19.07■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF98A6NK75 572 aa19.07■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF182Q8N6D2 247 aa19.07■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF738Q8NE65 137 aa19.07■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa19.07■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 EPM2AB3EWF7 344 aa19.06■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa19.06■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB11AP62491 216 aa19.06■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 RHOBP62745 196 aa19.06■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1B1Q8NGR6 318 aa19.06■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 UHRF2Q96PU4 802 aa19.06■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 CFDP00746 253 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
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