RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625282.2

SPTAN1-210, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 4,102 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-210ENST00000625282 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 VSTM5A8MXK1 200 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 AGFG2O95081 481 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 MYOD1P15172 320 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 MLANAQ16655 118 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 FOXF2Q12947 444 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 GFRALQ6UXV0 394 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 VWC2LB2RUY7 222 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 MT-ATP8P03928 68 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 ORM2P19652 201 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 Q6P435 159 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM189A5PLL7 270 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 TCF15Q12870 199 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 TEX29Q8N6K0 151 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 MBD6Q96DN6 1003 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.36□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 H3BVH4 76 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 P0C879 139 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 ERVK11-1P61568 191 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 HIST1H4GQ99525 98 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PSPNO60542 156 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 GPR82Q96P67 336 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 MGST3O14880 152 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 WNT9BO14905 357 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 RIGQ13278 110 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 Q8IYB0 196 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF503Q96F45 646 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 SPEGQ15772 3267 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PRR20EP86478 221 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PRR20CP86479 221 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PRR20DP86480 221 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PRR20BP86481 221 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PRR20AP86496 221 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 FGF6P10767 208 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PROCRQ9UNN8 238 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 A0A1B0GUT8 65 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 OR11H12B2RN74 326 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 LYZL6O75951 148 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 MOSP00540 346 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PRNTQ86SH4 94 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 OR11H1Q8NG94 326 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 OR11H2Q8NH07 326 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 GTSF1Q8WW33 167 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PKIBQ9C010 78 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 LTAP01374 205 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 MORN5Q5VZ52 161 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 FADS6Q8N9I5 356 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 WDR31Q8NA23 367 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 GLMPQ8WWB7 406 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 LEAP2Q969E1 77 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 A0A1B0GXF2 115 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 CITED1Q99966 193 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 TNCP24821 2201 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 hADV38S2A0JD32 116 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 SIVA1O15304 175 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 FAM106CPP0CH98 169 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 Q0VFX4 171 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 TTC32Q5I0X7 151 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF329Q86UD4 541 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 PRELID3AQ96N28 172 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms