RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616596.4

RDM1-220, Transcript of RAD52 motif containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDM1, Length 1,032 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1-220ENST00000616596 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.73□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 DOK5Q9P104 306 aa11.73□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 TRAV25A0A0B4J276 109 aa11.72□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 A0A1W2PS18 150 aa11.72□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 BUB3O43684 328 aa11.72□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 MPDU1O75352 247 aa11.72□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 RPL29P47914 159 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 RAB31Q13636 194 aa11.72□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 TCF24Q7RTU0 167 aa11.72□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 OR1B1Q8NGR6 318 aa11.72□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 GLMPQ8WWB7 406 aa11.72□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 ARL6Q9H0F7 186 aa11.72□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.72□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 TSPAN4O14817 238 aa11.71□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 ARPC5O15511 151 aa11.71□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 BMI1P35226 326 aa11.71□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 DEFA6Q01524 100 aa11.71□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 TCTE3Q8IZS6 198 aa11.71□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 NEURL2Q9BR09 285 aa11.71□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 PXMP4Q9Y6I8 212 aa11.71□□□□□ -0.53
RDM1-220ENST00000616596 HMSDA8MTL9 139 aa11.7□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 HYPMO75409 117 aa11.7□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 GUCA2BQ16661 112 aa11.7□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.7□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa11.7□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 GRAMD2BQ96HH9 432 aa11.7□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 UHRF2Q96PU4 802 aa11.7□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 RSG1Q9BU20 258 aa11.7□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 SLC39A9Q9NUM3 307 aa11.7□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 HIGD1AQ9Y241 93 aa11.7□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 ZNF98A6NK75 572 aa11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 H3BRN7 92 aa11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 K7EIL1 84 aa11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 IFNA5P01569 189 aa11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 OR5G3P0C626 314 aa11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 B2MP61769 119 aa11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 CD300CQ08708 224 aa11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 AKAP14Q86UN6 197 aa11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 TMEM37Q8WXS4 190 aa11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 PPP1R14BQ96C90 147 aa11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 MFFQ9GZY8 342 aa11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 ARV1Q9H2C2 271 aa11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 RFNGQ9Y644 331 aa11.69□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 CD5P06127 495 aa11.68□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 CD7P09564 240 aa11.68□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 C1orf194Q5T5A4 169 aa11.68□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 LEMD1Q68G75 181 aa11.68□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 Q8N1Y9 231 aa11.68□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 GBGT1Q8N5D6 347 aa11.68□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 SCGB1C1Q8TD33 95 aa11.68□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.68□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 SCRT1Q9BWW7 348 aa11.68□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.68□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 COX7A2P2O60397 106 aa11.67□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 CXCL2P19875 107 aa11.67□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 TFPI2P48307 235 aa11.67□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 ZNF266Q14584 549 aa11.67□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 GCSAMLQ5JQS6 135 aa11.67□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 MORN5Q5VZ52 161 aa11.67□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.67□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 Q6ZRG5 221 aa11.67□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.67□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 ZNF709Q8N972 641 aa11.67□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 SLC25A32Q9H2D1 315 aa11.67□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 MS4A6AQ9H2W1 248 aa11.67□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 SLC25A22Q9H936 323 aa11.67□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 HELTA6NFD8 242 aa11.66□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 C17orf112F2Z3M2 114 aa11.66□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 C1QBP02746 253 aa11.66□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 CD81P60033 236 aa11.66□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 ZNF345Q14585 488 aa11.66□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 C10orf113Q5VZT2 155 aa11.66□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.66□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 OR1L4Q8NGR5 311 aa11.66□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa11.66□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 CYTL1Q9NRR1 136 aa11.66□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 OR4C46A6NHA9 309 aa11.65□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 WFDC3Q8IUB2 231 aa11.65□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 OR8I2Q8N0Y5 310 aa11.65□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.65□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 STXBP6Q8NFX7 210 aa11.65□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 C17orf77Q96MU5 243 aa11.65□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 PFDN5Q99471 154 aa11.65□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 KCNIP2Q9NS61 270 aa11.65□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.65□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa11.65□□□□□ -0.54
RDM1-220ENST00000616596 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.64□□□□□ -0.55
RDM1-220ENST00000616596 K7EQG2 157 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 151 ms