RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ID1P41134 155 aa18.19■□□□□ 0.5
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CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf158Q8N1D5 194 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-211ENST00000590874 COQ8AQ8NI60 647 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-211ENST00000590874 C15orf40Q8WUR7 153 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-211ENST00000590874 SRRQ9GZT4 340 aa18.19■□□□□ 0.5
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CAPNS1-211ENST00000590874 OXA1LQ15070 435 aa18.17■□□□□ 0.5
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CAPNS1-211ENST00000590874 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
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CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0J9YX75 114 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAIN1P0CW23 69 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-211ENST00000590874 CCR6P51684 374 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-211ENST00000590874 SMCO1Q147U7 214 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-211ENST00000590874 RRN3P1Q2M238 152 aa18.13■□□□□ 0.49
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CAPNS1-211ENST00000590874 C20orf173Q96LM9 149 aa18.13■□□□□ 0.49
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CAPNS1-211ENST00000590874 AMTNQ6UX39 209 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf77Q96MU5 243 aa18.09■□□□□ 0.49
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CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa18.08■□□□□ 0.48
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CAPNS1-211ENST00000590874 DEFA3P59666 94 aa18.08■□□□□ 0.48
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CAPNS1-211ENST00000590874 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 IFITM3Q01628 133 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 TNP2Q05952 138 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 BAK1Q16611 211 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 C15orf53Q8NAA6 179 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM208Q9BTX3 173 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A32Q9H2D1 315 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 AKR1C4P17516 323 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS21Q2M5E4 152 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD13Q5VXD3 122 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1S1Q8NH92 325 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 INPP1P49441 399 aa18.05■□□□□ 0.48
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