RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	NEURL2	Q9BR09	285 aa		18.73	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	ARL6	Q9H0F7	186 aa		18.73	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	OR4C46	A6NHA9	309 aa		18.72	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	CD5	P06127	495 aa		18.72	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	CD7	P09564	240 aa		18.72	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	PAFAH1B2	P68402	229 aa		18.72	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229		Q5BKY6	102 aa		18.72	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		18.72	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		18.72	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	ATP5S	Q99766	215 aa		18.72	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		18.71	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		18.71	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		18.71	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A22	Q9H936	323 aa		18.71	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		18.71	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		18.71	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229		U3KQE9	123 aa		18.71	■□□□□ 0.59
GPS1-223	ENST00000584229	HYPM	O75409	117 aa		18.7	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	S100A7	P31151	101 aa		18.7	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	MIC13	Q5XKP0	118 aa		18.7	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		18.7	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		18.7	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	HELT	A6NFD8	242 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	BUB3	O43684	328 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	STPG3	Q8N7X2	389 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	GLMP	Q8WWB7	406 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	SMLR1	H3BR10	107 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	COX7A2P2	O60397	106 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	MPDU1	O75352	247 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229		Q6ZNX1	250 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	IFNA5	P01569	189 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	OPCML	Q14982	345 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229		Q6ZRG5	221 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229		Q8N1Y9	231 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF709	Q8N972	641 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	UHRF2	Q96PU4	802 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	FBXL17	Q9UF56	701 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	OR11H12	B2RN74	326 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	B2M	P61769	119 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	LEMD1	Q68G75	181 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	S100A7A	Q86SG5	101 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	ARV1	Q9H2C2	271 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	TUBA4B	Q9H853	241 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	PLP1	P60201	277 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB125	Q8N687	156 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	AQP10	Q96PS8	301 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF98	A6NK75	572 aa		18.64	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		18.64	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229		H3BRN7	92 aa		18.64	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		18.64	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		18.64	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		18.64	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		18.63	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		18.63	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		18.63	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		18.63	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		18.63	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	ARPC5	O15511	151 aa		18.62	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	PRR20E	P86478	221 aa		18.62	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	PRR20C	P86479	221 aa		18.62	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	PRR20D	P86480	221 aa		18.62	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	PRR20B	P86481	221 aa		18.62	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	PRR20A	P86496	221 aa		18.62	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	PATE2	Q6UY27	113 aa		18.62	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		18.62	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	PFDN5	Q99471	154 aa		18.62	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		18.62	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	WFDC1	Q9HC57	220 aa		18.62	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229		G3V3Q6	166 aa		18.61	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	GALR1	P47211	349 aa		18.61	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		18.61	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	RSG1	Q9BU20	258 aa		18.61	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	NRN1	Q9NPD7	142 aa		18.61	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		18.6	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		18.6	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		18.59	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	RNF222	A6NCQ9	220 aa		18.59	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229		K7EQG2	157 aa		18.59	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF688	P0C7X2	276 aa		18.59	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF266	Q14584	549 aa		18.59	■□□□□ 0.57
GPS1-223	ENST00000584229	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		18.59	■□□□□ 0.57

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