RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 H7BYZ3 331 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 PAX4O43316 350 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 RHOBP62745 196 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 FABP5Q01469 135 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 ASAH1Q13510 395 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 BSXQ3C1V8 233 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 CYGBQ8WWM9 190 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 NPIPB3Q92617 1050 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 NXPH3O95157 252 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 RAB3BP20337 219 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 S100GP29377 79 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 HTR2BP41595 481 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 Q6ZTI0 123 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 EHFQ9NZC4 300 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 MYL9P24844 172 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 GALR1P47211 349 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 TAS2R20P59543 309 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 LELP1Q5T871 98 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 Q6ZRU5 148 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 ACY3Q96HD9 319 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
GGA3-212ENST00000582376 CDKN1BP46527 198 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 LYZP61626 148 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 LINC01620Q4KN68 170 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 C2orf83Q53S99 150 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 ZNF738Q8NE65 137 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 OR52E5Q8NH55 327 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 RSG1Q9BU20 258 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 IGKV1-5P01602 117 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 IGLV2-11P01706 119 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 OR5AC1P0C628 307 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 RFX2P48378 723 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 AKR1C2P52895 323 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 WFDC2Q14508 124 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 TDRG1Q3Y452 100 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 RNF182Q8N6D2 247 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 Q9HAA7 133 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 SMIM30A4D0T7 59 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 PTGES3LE9PB15 166 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 SLAQ13239 276 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 PSG3Q16557 428 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 SLC25A22Q9H936 323 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 IFT46Q9NQC8 304 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 DIABLOQ9NR28 239 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 PRO0255Q9UI72 69 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 FUT9Q9Y231 359 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 TNXBP22105 4242 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 ZFP92A6NM28 416 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 PRAF2O60831 178 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 ATG12O94817 140 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 PMP2P02689 132 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 SRIP30626 198 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-212ENST00000582376 CRYBA4P53673 196 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms