RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 ID1P41134 155 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 P2RY1P47900 373 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 COX19Q49B96 90 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 PSMG4Q5JS54 123 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 DCANP1Q8TF63 244 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 METTL26Q96S19 204 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 MGLLQ99685 303 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 ATG101Q9BSB4 218 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1B0GU03 582 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1B0GV72 72 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 GOSR2O14653 212 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 SNAI2O43623 268 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM50AO95807 157 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 HERV-K104P61576 105 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 DHRS2Q13268 280 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 BSXQ3C1V8 233 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 HOGA1Q86XE5 327 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF114Q8NC26 417 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 DKK2Q9UBU2 259 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 GPR132Q9UNW8 380 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 RFNGQ9Y644 331 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 EPM2AB3EWF7 344 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 PET100P0DJ07 73 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 CRYBB3P26998 211 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 GNRHRP30968 328 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 MEOX2P50222 304 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 OXA1LQ15070 435 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 OR4A16Q8NH70 328 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM230Q96A57 120 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 H3BMM0 161 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 IFNA5P01569 189 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 SNCAP37840 140 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 HERV-K104P63124 156 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 PRCDQ00LT1 54 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 FAT1Q14517 4588 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 AGRNO00468 2067 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1B0GV90 55 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 M0QYG6 137 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM6P0DI80 62 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 RCVRNP35243 200 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 FXYD7P58549 80 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 DAD1P61803 113 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE1Q13065 139 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 TRIQKQ629K1 86 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 C22orf42Q6IC83 251 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 OR51M1Q9H341 326 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 DUSP21Q9H596 190 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 EHFQ9NZC4 300 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 RS1O15537 224 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV3-20P01619 116 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 HBE1P02100 147 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 PPBPP02775 128 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 HLA-DRB4P13762 266 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 BLOC1S1P78537 153 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 RNF151Q2KHN1 245 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 SPINK9Q5DT21 86 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZNX1 250 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 S100A7AQ86SG5 101 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 PFDN5Q99471 154 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
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