RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	S100A7	P31151	101 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	LEMD1	Q68G75	181 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	RNF183	Q96D59	192 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRAF2	O60831	178 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF688	P0C7X2	276 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	DEFA1	P59665	94 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	DEFA3	P59666	94 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	SELENOT	P62341	195 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	IL15RA	Q13261	267 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	DEFB135	Q30KP9	77 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	IL17D	Q8TAD2	202 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-208	ENST00000578501	SMCO3	A2RU48	225 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501		L7N2F9	121 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	DEDD	O75618	318 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCNK	O75909	580 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	PLP1	P60201	277 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	VAMP2	P63027	116 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	STH	Q8IWL8	128 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF98	A6NK75	572 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARL16	Q0P5N6	197 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	TEPP	Q6URK8	271 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPP1	P10451	314 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	ORM2	P19652	201 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	PSMG4	Q5JS54	123 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPR82	Q96P67	336 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	SOCS3	O14543	225 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	HYPM	O75409	117 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	ID1	P41134	155 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	GALR1	P47211	349 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	PSMB3	P49720	205 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	BCAP31	P51572	246 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	CAV2	P51636	162 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAB32	Q13637	225 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	S100A7A	Q86SG5	101 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	NMES1	Q9C002	83 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	LYST	Q99698	3801 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	KNCN	A6PVL3	124 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	ISLR	O14498	428 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	LINC00869	P0C866	280 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	MEOX2	P50222	304 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	S100A10	P60903	97 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAP2B	P61225	183 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF546	Q86UE3	836 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	RNF24	Q9Y225	148 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501		A0A0J9YWU9	116 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501		H3BMM0	161 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501		H3BRN7	92 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	GOSR2	O14653	212 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	CST7	O76096	145 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	S100A11	P31949	105 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	SULT1A1	P50225	295 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAB31	Q13636	194 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	VWC2	Q2TAL6	325 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	STX12	Q86Y82	276 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	RARRES2	Q99969	163 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC25A22	Q9H936	323 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-208	ENST00000578501	AGPAT2	O15120	278 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CSNK1D-208	ENST00000578501	RLN2	P04090	185 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CSNK1D-208	ENST00000578501	HLA-DRB4	P13762	266 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CSNK1D-208	ENST00000578501	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82

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