RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM41BQ5BJD5 291 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM3-211ENST00000565922 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM3-211ENST00000565922 GSG1LQ6UXU4 331 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM3-211ENST00000565922 C2orf50Q96LR7 162 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM3-211ENST00000565922 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.62□□□□□ -0.07
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CMTM3-211ENST00000565922 DEFA3P59666 94 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-211ENST00000565922 SELENOTP62341 195 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-211ENST00000565922 ZFAND6Q6FIF0 208 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-211ENST00000565922 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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CMTM3-211ENST00000565922 S100A7AQ86SG5 101 aa14.6□□□□□ -0.07
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CMTM3-211ENST00000565922 ID1P41134 155 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-211ENST00000565922 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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CMTM3-211ENST00000565922 MEOX2P50222 304 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 BCAP31P51572 246 aa14.58□□□□□ -0.08
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CMTM3-211ENST00000565922 ACTL10Q5JWF8 245 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 TEPPQ6URK8 271 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 CCNKO75909 580 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 PSMB3P49720 205 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 CAV2P51636 162 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 RARRES2Q99969 163 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 RNF24Q9Y225 148 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 A0A0J9YWU9 116 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF98A6NK75 572 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 KNCNA6PVL3 124 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 DEDDO75618 318 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 LINC00869P0C866 280 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 S100A10P60903 97 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
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CMTM3-211ENST00000565922 NRARPQ7Z6K4 114 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF546Q86UE3 836 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 SLC25A22Q9H936 323 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 PLP1P60201 277 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
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CMTM3-211ENST00000565922 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 RAB31Q13636 194 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 STX12Q86Y82 276 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 OR11H2Q8NH07 326 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.54□□□□□ -0.08
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CMTM3-211ENST00000565922 H3BRN7 92 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 OR5G3P0C626 314 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 IL15RAQ13261 267 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 RAB32Q13637 225 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.53□□□□□ -0.08
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CMTM3-211ENST00000565922 C11orf1Q9H5F2 150 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 DOK5Q9P104 306 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM3-211ENST00000565922 SOCS3O14543 225 aa14.52□□□□□ -0.09
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CMTM3-211ENST00000565922 HBG1P69891 147 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 HBG2P69892 147 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 ARL16Q0P5N6 197 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 C16orf92Q96LL3 132 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 LINC00052Q96N35 136 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 FAM24AA6NFZ4 105 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 AGPAT2O15120 278 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 CST7O76096 145 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 RLN2P04090 185 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 S100A11P31949 105 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 SULT1A1P50225 295 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 SCRT1Q9BWW7 348 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 NMES1Q9C002 83 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM3-211ENST00000565922 ARL6Q9H0F7 186 aa14.51□□□□□ -0.09
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