RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 SSSCA1O60232 199 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 TSC22D2O75157 780 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 YIF1AO95070 293 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 SCGB1D2O95969 90 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 PTTG1O95997 202 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 IGKV1-17P01599 117 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 OR10J1P30954 320 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 PAX9P55771 341 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 TAS2R30P59541 319 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 GAMTQ14353 236 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 GUCA2BQ16661 112 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 TIGITQ495A1 244 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 BTNL8Q6UX41 500 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 SLC35E1Q96K37 410 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 C2orf50Q96LR7 162 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 H3BP45 60 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 K7EPK0 472 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 CHEK1O14757 476 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 TSPAN4O14817 238 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 TOMM40O96008 361 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 OXTP01178 125 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 IL15RAQ13261 267 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 THAP8Q8NA92 274 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 Q8WTZ3 238 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 ACY3Q96HD9 319 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 VSIRQ9H7M9 311 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 SMPXQ9UHP9 88 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-225ENST00000551253 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 A0A1W2PS18 150 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 C7orf66A4D0T2 115 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 ZFP92A6NM28 416 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 C11orf94C9JXX5 98 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 FNDC10F2Z333 226 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 GOSR2O14653 212 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 CD5P06127 495 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 NPPCP23582 126 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 CRYBB3P26998 211 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 KRTAP10-2P60368 255 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 Q6ZWC4 215 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 METTL26Q96S19 204 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 RNF2Q99496 336 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 TRGV9Q99603 122 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 NMES1Q9C002 83 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 L7N2F9 121 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 CCNKO75909 580 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 APOHP02749 345 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 IL4P05112 153 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 FABP1P07148 127 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 RD3LP0DJH9 198 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 PSG1P11464 419 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 S100A10P60903 97 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 VAMP2P63027 116 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 DLK1P80370 383 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 ZNF90Q03938 601 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 RAB32Q13637 225 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 KIR3DS1Q14943 382 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 TMEM144Q7Z5S9 345 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 ST8SIA2Q92186 375 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 RNF125Q96EQ8 232 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CS-225ENST00000551253 GGACTQ9BVM4 153 aa5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms