RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545331.5

TULP3-208, Transcript of tubby like protein 3, human

TSL 2

Gene TULP3, Length 1,373 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TULP3-208	ENST00000545331	DEFB125	Q8N687	156 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	AGPAT2	O15120	278 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	LINC00869	P0C866	280 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	FCN2	Q15485	313 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	RNF126	Q9BV68	326 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	RNF24	Q9Y225	148 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	MPDU1	O75352	247 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	ORM2	P19652	201 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	TFPI2	P48307	235 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	RAP2B	P61225	183 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331		K7EQG2	157 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	LYL1	P12980	280 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	FGL1	Q08830	312 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	THAP6	Q8TBB0	222 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	DCANP1	Q8TF63	244 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	GPR82	Q96P67	336 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	MGST2	Q99735	147 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	NRN1	Q9NPD7	142 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	MBD2	Q9UBB5	411 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	HYPM	O75409	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	CAMLG	P49069	296 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	NHLH2	Q02577	135 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	STPG3	Q8N7X2	389 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF98	A6NK75	572 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	TG	P01266	2768 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331		H3BRN7	92 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	GALR1	P47211	349 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331		Q6ZRG5	221 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	ASCL2	Q99929	193 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	ARL6	Q9H0F7	186 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	ZMAT4	Q9H898	229 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	HSPB11	Q9Y547	144 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	OR5G3	P0C626	314 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	FGF7	P21781	194 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	MEOX2	P50222	304 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	PRR20E	P86478	221 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	PRR20C	P86479	221 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	PRR20D	P86480	221 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	PRR20B	P86481	221 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	PRR20A	P86496	221 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	OPCML	Q14982	345 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	HAGH	Q16775	308 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	CITED4	Q96RK1	184 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	ARV1	Q9H2C2	271 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	DOK5	Q9P104	306 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	ATP5S	Q99766	215 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	SLC25A22	Q9H936	323 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	DEFB131A	P59861	70 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	B2M	P61769	119 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	CLINT1	Q14677	625 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	PFDN5	Q99471	154 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	SPATA25	Q9BR10	227 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	COX7A2P2	O60397	106 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	APOC4	P55056	127 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	MIC13	Q5XKP0	118 aa		13.61	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms