RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 BMI1P35226 326 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 SELENOTP62341 195 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 NHLH2Q02577 135 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 LILRB2Q8N423 598 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLSTN3-212ENST00000541770 MLXQ9UH92 298 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLSTN3-212ENST00000541770 ZFP69Q49AA0 526 aa6.49□□□□□ -1.37
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CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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CLSTN3-212ENST00000541770 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.49□□□□□ -1.37
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CLSTN3-212ENST00000541770 HSPB11Q9Y547 144 aa6.49□□□□□ -1.37
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CLSTN3-212ENST00000541770 HERC2O95714 4834 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.47□□□□□ -1.37
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CLSTN3-212ENST00000541770 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.47□□□□□ -1.37
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CLSTN3-212ENST00000541770 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.46□□□□□ -1.38
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CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.46□□□□□ -1.38
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CLSTN3-212ENST00000541770 HYPMO75409 117 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00869P0C866 280 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 FGF7P21781 194 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 PRR20EP86478 221 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 PRR20CP86479 221 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 PRR20DP86480 221 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 PRR20BP86481 221 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 PRR20AP86496 221 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 CLINT1Q14677 625 aa6.46□□□□□ -1.38
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