RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530565.5

CTSF-208, Transcript of cathepsin F, humanhuman

TSL 5

Gene CTSF, Length 555 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSF-208ENST00000530565 FGF7P21781 194 aa6.52□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 OR10J1P30954 320 aa6.52□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 CAMLGP49069 296 aa6.52□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 INSL3P51460 131 aa6.52□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 SELENOTP62341 195 aa6.52□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 TIGITQ495A1 244 aa6.52□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.52□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.52□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 THAP8Q8NA92 274 aa6.52□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.52□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.52□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.52□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 TMEM213A2RRL7 107 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 SMCO3A2RU48 225 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 LINC00862A6NCI5 91 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 C2orf70A6NJV1 201 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 YIF1AO95070 293 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 EDN2P20800 178 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 KRTAP10-11P60412 298 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 AKR1C1Q04828 323 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 ZFP92A6NM28 416 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 TEX46H3BTG2 121 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 K7EMT4 169 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 AGPAT2O15120 278 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 TOMM40O96008 361 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 FABP1P07148 127 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 FOLR2P14207 255 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 CBLN1P23435 193 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 RAB2AP61019 212 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 PRR20EP86478 221 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 PRR20CP86479 221 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 PRR20DP86480 221 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 PRR20BP86481 221 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 PRR20AP86496 221 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 TM4SF20Q53R12 229 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 Q6ZRG5 221 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 Q8WTZ3 238 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 TRGV9Q99603 122 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 MGST2Q99735 147 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 RSG1Q9BU20 258 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 IGLV1-51P01701 117 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 HBE1P02100 147 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 RD3LP0DJH9 198 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 C8orf88P0DMB2 117 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 PSG1P11464 419 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 M6PRP20645 277 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 ZNF90Q03938 601 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 PMS2P11Q13670 270 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 MARC2Q969Z3 335 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 RPRMQ9NS64 109 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.49□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.48□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 LINC00869P0C866 280 aa6.48□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.48□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.48□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.48□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.48□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.48□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.48□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.48□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 RNF2Q99496 336 aa6.48□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 B9D2Q9BPU9 175 aa6.48□□□□□ -1.37
CTSF-208ENST00000530565 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms