RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.6□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 A0A0B4J2A0 478 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 CTDSPLO15194 276 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 RTL8CO15255 209 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 HBE1P02100 147 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 ANXA3P12429 323 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 AKR1C4P17516 323 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 RAB11AP62491 216 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 PSG9Q00887 426 aa8.59□□□□□ -1.03
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CNOT4-211ENST00000498534 IL18Q14116 193 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 GAMTQ14353 236 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 OR1S1Q8NH92 325 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT4-211ENST00000498534 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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CNOT4-211ENST00000498534 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.59□□□□□ -1.03
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CNOT4-211ENST00000498534 DNAH2Q9P225 4427 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 ISLRO14498 428 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 HTN3P15516 51 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 DEFB1P60022 68 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 LYZP61626 148 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 SRPXP78539 464 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 OXA1LQ15070 435 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 RNF212Q495C1 297 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 RPRMQ9NS64 109 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 MCUBQ9NWR8 336 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 PRR13Q9NZ81 148 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 MEOX2P50222 304 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 OR2F1Q13607 317 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF79Q15937 498 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 RRN3P1Q2M238 152 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 FAM78BQ5VT40 261 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF709Q8N972 641 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 C16orf92Q96LL3 132 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.56□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.56□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 GHRHP01286 108 aa8.56□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 S100A7P31151 101 aa8.56□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 GALR1P47211 349 aa8.56□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 PAX9P55771 341 aa8.56□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 DAD1P61803 113 aa8.56□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 GPR141Q7Z602 305 aa8.56□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 TRGV9Q99603 122 aa8.56□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 MUC4Q99102 2169 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 A0A0J9YX75 114 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 F6UB75 175 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 SOCS3O14543 225 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 MED6O75586 246 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 XP32Q5T750 250 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZR54 194 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 RSG1Q9BU20 258 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 DOK5Q9P104 306 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 PKD1P98161 4303 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 SMIM18P0DKX4 95 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 SPCS2Q15005 226 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A22Q9H936 323 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 FABP12A6NFH5 140 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 IAPPP10997 89 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 B2MP61769 119 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 THAP8Q8NA92 274 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 GPR82Q96P67 336 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 ATG101Q9BSB4 218 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF98A6NK75 572 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 PITX3O75364 302 aa8.52□□□□□ -1.05
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