RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 THADAQ6YHU6 1953 aa14.88□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ITGB1BP1O14713 200 aa14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NTF4P34130 210 aa14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IL18BPO95998 194 aa14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CYSLTR1Q9Y271 337 aa14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.86□□□□□ -0.03
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.86□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GFRA4Q9GZZ7 299 aa14.86□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GUSBP1Q15486 140 aa14.86□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PAX1P15863 534 aa14.86□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.86□□□□□ -0.03
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PAX9P55771 341 aa14.85□□□□□ -0.03
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TIMM23O14925 209 aa14.85□□□□□ -0.03
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IGLC3P0DOY3 106 aa14.85□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CD33P20138 364 aa14.85□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 Q0VFX4 171 aa14.85□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ANAPC13Q9BS18 74 aa14.85□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TNFRSF14Q92956 283 aa14.85□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRGV9Q99603 122 aa14.85□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.85□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TDGF1P13385 188 aa14.85□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 A8MWV9 139 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TGFAP01135 160 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NPFFO15130 113 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PSG1P11464 419 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WDR81Q562E7 1941 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DNAL4O96015 105 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF581Q9P0T4 197 aa14.83□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RHOGP84095 191 aa14.83□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 Q5PR19 223 aa14.83□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM231BA6NCW3 169 aa14.82□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.82□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BMPERQ8N8U9 685 aa14.82□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CST9LQ9H4G1 147 aa14.82□□□□□ -0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 E9PLN8 166 aa14.82□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PAX2Q02962 417 aa14.82□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF726P1Q15940 193 aa14.82□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VKORC1Q9BQB6 163 aa14.82□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LINC00473A8K010 186 aa14.81□□□□□ -0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.81□□□□□ -0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CT83Q5H943 113 aa14.8□□□□□ -0.04
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LIME1Q9H400 295 aa14.8□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PF4P02776 101 aa14.8□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 D6R8Y8 96 aa14.8□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 H3BRM9 83 aa14.8□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GLMPQ8WWB7 406 aa14.8□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DUX3Q96PT4 197 aa14.8□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa14.8□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.8□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VWA8A3KMH1 1905 aa14.8□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 THBDP07204 575 aa14.79□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PTPRDP23468 1912 aa14.79□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF815PA8K554 130 aa14.79□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PPIFP30405 207 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LAGE3Q14657 143 aa14.79□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.79□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.79□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PLNP26678 52 aa14.79□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.79□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.79□□□□□ -0.04
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