RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 OR4X2Q8NGF9 303 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 OTOSQ8NHW6 89 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC140Q96MF4 163 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 AQP10Q96PS8 301 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 PXMP4Q9Y6I8 212 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 EFNA4P52798 201 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR20EP86478 221 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR20CP86479 221 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR20DP86480 221 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR20BP86481 221 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR20AP86496 221 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 KIR3DS1Q14943 382 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 ACP7Q6ZNF0 438 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 GLIPR2Q9H4G4 154 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PS29 197 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC17A2O00624 439 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 GCSHP23434 173 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 CDAP32320 146 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 PFN2P35080 140 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 FAUP35544 74 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 RND3P61587 244 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 INSL4Q14641 139 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 DPH3Q96FX2 82 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 SMR3AQ99954 134 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 REEP1Q9H902 201 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF407Q9C0G0 2248 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 SNCGO76070 127 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 NTN1O95631 604 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 CLPSP04118 112 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 TACSTD2P09758 323 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 CECR9P0C854 216 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 OPRK1P41145 380 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 PTGDSP41222 190 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 BSPH1Q075Z2 132 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 MFSD12Q6NUT3 480 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2T10Q8NGZ9 312 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM213BQ8TBF2 198 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB37Q96AX2 223 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 PBOV1Q9GZY1 135 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV5A0A0B4J249 113 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 LY6LH3BQJ8 138 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 OVOL1O14753 267 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 FGF6P10767 208 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 AAED1Q7RTV5 226 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 RFLNBQ8N5W9 214 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 OR11H6Q8NGC7 330 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF128Q8TEB7 428 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 MTORP42345 2549 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1B0GV50 99 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 USP17L23D6RBM5 183 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM262E9PQX1 116 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 LYZL6O75951 148 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMB3P49720 205 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 B3GALT5-AS1P59052 145 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 ICAM4Q14773 271 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 BAGE3Q86Y29 109 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 BAGE2Q86Y30 109 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 GAPTQ8N292 157 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV4A0A0B4J268 109 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 JTBO76095 146 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 PRH1P02810 166 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 FSTP19883 344 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 MOB3BQ86TA1 216 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 OR52N5Q8NH56 324 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS4Y2Q8TD47 263 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 BORCS7Q96B45 105 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 C5orf63A6NC05 138 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 H0YIZ8 118 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 M0QYG6 137 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC2A10O95528 541 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-213ENST00000496055 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
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