RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495300.1

PBX2-204, Transcript of PBX homeobox 2, human

TSL 3

Gene PBX2, Length 920 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PBX2-204	ENST00000495300	AGPAT2	O15120	278 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	LYL1	P12980	280 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	TFPI2	P48307	235 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	HBG1	P69891	147 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	HBG2	P69892	147 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	STX12	Q86Y82	276 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	ASCL2	Q99929	193 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	MED28	Q9H204	178 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	TUBA4B	Q9H853	241 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	LINC00869	P0C866	280 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	PET100	P0DJ07	73 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	HAGH	Q16775	308 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	ATP6V1F	Q16864	119 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	ORM2	P19652	201 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	BAX	Q07812	192 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	PATE2	Q6UY27	113 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	ZNF546	Q86UE3	836 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	C17orf77	Q96MU5	243 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	MBD2	Q9UBB5	411 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	ZNF98	A6NK75	572 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	CAMLG	P49069	296 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	PRR20E	P86478	221 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	PRR20C	P86479	221 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	PRR20D	P86480	221 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	PRR20B	P86481	221 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	PRR20A	P86496	221 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	ZNF124	Q15973	351 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	ASB13	Q8WXK3	278 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	NRN1	Q9NPD7	142 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	FBXL17	Q9UF56	701 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PBX2-204	ENST00000495300	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300		H3BRN7	92 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	HYPM	O75409	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	ARL6	Q9H0F7	186 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	DOK5	Q9P104	306 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	SOCS3	O14543	225 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	MPDU1	O75352	247 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	DEFB131A	P59861	70 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	RAB31	Q13636	194 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	OPCML	Q14982	345 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300		Q5BKY6	102 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	MIC13	Q5XKP0	118 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	UHRF2	Q96PU4	802 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	ARV1	Q9H2C2	271 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	HSPB11	Q9Y547	144 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	TENM3	Q9P273	2699 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	OR5G3	P0C626	314 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	FGF7	P21781	194 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	S100A7	P31151	101 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	RAP2B	P61225	183 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	LEMD1	Q68G75	181 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	THAP6	Q8TBB0	222 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	GPR82	Q96P67	336 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	SLC25A22	Q9H936	323 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300		U3KQK5	164 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	ZNF688	P0C7X2	276 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	FGL1	Q08830	312 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	CLINT1	Q14677	625 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PBX2-204	ENST00000495300	ATP5S	Q99766	215 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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