RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489842.1

GTF3C5-210, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene GTF3C5, Length 696 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-210ENST00000489842 HRH4Q9H3N8 390 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 DOK5Q9P104 306 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 CCDC160A6NGH7 325 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 SFT2D2O95562 160 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 ANXA3P12429 323 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 HTN3P15516 51 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 ORM2P19652 201 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 BAK1Q16611 211 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM78BQ5VT40 261 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 RNF182Q8N6D2 247 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 THAP8Q8NA92 274 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 RSG1Q9BU20 258 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 C11orf94C9JXX5 98 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 CCDC190Q86UF4 302 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 NOXA1Q86UR1 476 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.49□□□□□ -1.37
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GTF3C5-210ENST00000489842 TRGV9Q99603 122 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.49□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 A0A0J9YX75 114 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 SMCO3A2RU48 225 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF98A6NK75 572 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 M0R2Z0 102 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 SYNGR2O43760 224 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 PSMB3P49720 205 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 RAB11AP62491 216 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 PSG9Q00887 426 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 FGL1Q08830 312 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 FCN2Q15485 313 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 AMTNQ6UX39 209 aa6.48□□□□□ -1.37
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GTF3C5-210ENST00000489842 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 LRTM2Q8N967 370 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 C16orf92Q96LL3 132 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 RNF126Q9BV68 326 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 SRRQ9GZT4 340 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 DKK2Q9UBU2 259 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 NACAE9PAV3 2078 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 A0A1B0GVY2 172 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 C9orf170A2RU37 121 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 A6NHS1 94 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 RTL8CO15255 209 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 AMBPP02760 352 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 AZU1P20160 251 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 ID1P41134 155 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 PAX9P55771 341 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 SRPXP78539 464 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 AKR1C1Q04828 323 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 ARL16Q0P5N6 197 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 UHRF2Q96PU4 802 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 RYR1P21817 5038 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C5-210ENST00000489842 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 H3BTX0 84 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 CCSO14618 274 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SSSCA1O60232 199 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SCGB1D2O95969 90 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 BTCP35070 178 aa6.46□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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