RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	IGKV1-17	P01599	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	IGLC1	P0CG04	106 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	OR10J1	P30954	320 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	TIGIT	Q495A1	244 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	RARRES2	Q99969	163 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	CST7	O76096	145 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	YIF1A	O95070	293 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	PET100	P0DJ07	73 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	P2RY1	P47900	373 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	DLK1	P80370	383 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	ARL16	Q0P5N6	197 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	IGSF23	A1L1A6	192 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	ZFP92	A6NM28	416 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	FNDC10	F2Z333	226 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344		K7EMT4	169 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	RTL8C	O15255	209 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	DEFB4A	O15263	64 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	SULT1A1	P50225	295 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344		Q6ZNX1	250 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344		Q8WTZ3	238 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	ASB13	Q8WXK3	278 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	MARC2	Q969Z3	335 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	GGACT	Q9BVM4	153 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	SMCO3	A2RU48	225 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	RD3L	P0DJH9	198 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	C8orf88	P0DMB2	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	S100A11	P31949	105 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	RAP2B	P61225	183 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	NHLH2	Q02577	135 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	AKR1C1	Q04828	323 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF575	Q86XF7	245 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	STX12	Q86Y82	276 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	THAP8	Q8NA92	274 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	OR11H2	Q8NH07	326 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	THAP6	Q8TBB0	222 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	TRGV9	Q99603	122 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	HERC1	Q15751	4861 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	TOMM40	O96008	361 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	PSG1	P11464	419 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF90	Q03938	601 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	FGL1	Q08830	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	GINS3	Q9BRX5	216 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	MBD2	Q9UBB5	411 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344		M0R2N4	97 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	TSPAN4	O14817	238 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	FABP1	P07148	127 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	HBG1	P69891	147 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	HBG2	P69892	147 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	ATP6V1F	Q16864	119 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344		Q5BKY6	102 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	CSTL1	Q9H114	145 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM3-208	ENST00000489344	C11orf94	C9JXX5	98 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	NPPC	P23582	126 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	BAX	Q07812	192 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	OR2F1	Q13607	317 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	TEPP	Q6URK8	271 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	LILRB2	Q8N423	598 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	SMPX	Q9UHP9	88 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	OR4C46	A6NHA9	309 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	IL4	P05112	153 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF124	Q15973	351 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	VWC2	Q2TAL6	325 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM3-208	ENST00000489344	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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