RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	PRR20D	P86480	221 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	PRR20B	P86481	221 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	PRR20A	P86496	221 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	OR2F1	Q13607	317 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	OPCML	Q14982	345 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	TCF24	Q7RTU0	167 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	THAP6	Q8TBB0	222 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	NEURL2	Q9BR09	285 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	HELT	A6NFD8	242 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	CD7	P09564	240 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00869	P0C866	280 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	S100A7	P31151	101 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	CD81	P60033	236 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	GUCA2B	Q16661	112 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290		Q6ZNX1	250 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	AQP10	Q96PS8	301 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290		H3BRN7	92 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	CAMLG	P49069	296 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB31	Q13636	194 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290		Q5BKY6	102 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	DCANP1	Q8TF63	244 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	ATP5S	Q99766	215 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	B9D2	Q9BPU9	175 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	FBXL17	Q9UF56	701 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	TENM3	Q9P273	2699 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF98	A6NK75	572 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290		K7EQG2	157 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	HYPM	O75409	117 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	PAFAH1B2	P68402	229 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	PATE2	Q6UY27	113 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
HCLS1-208	ENST00000487290	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	ORM2	P19652	201 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	FGF7	P21781	194 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	CLINT1	Q14677	625 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	S100A7A	Q86SG5	101 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	GPR82	Q96P67	336 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	NRN1	Q9NPD7	142 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	RNF24	Q9Y225	148 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	RNF222	A6NCQ9	220 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	OR11H12	B2RN74	326 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	SOCS3	O14543	225 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	B2M	P61769	119 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	C17orf77	Q96MU5	243 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	ARL6	Q9H0F7	186 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	ARV1	Q9H2C2	271 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	MIC13	Q5XKP0	118 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	PFDN5	Q99471	154 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	WFDC1	Q9HC57	220 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290		Q6ZRG5	221 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFB125	Q8N687	156 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	CITED4	Q96RK1	184 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	DOK5	Q9P104	306 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A087X0K7	114 aa		12.29	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	MEOX2	P50222	304 aa		12.29	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF266	Q14584	549 aa		12.29	□□□□□ -0.44
HCLS1-208	ENST00000487290	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		12.29	□□□□□ -0.44

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