RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486420.1

C9orf16-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf16, Length 434 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-202ENST00000486420 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 IGSF23A1L1A6 192 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 K7EIL1 84 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 AGPAT2O15120 278 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 LINC00869P0C866 280 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 ID1P41134 155 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 ST8SIA2Q92186 375 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 B9D2Q9BPU9 175 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 HSPB11Q9Y547 144 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 OR11H12B2RN74 326 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 COX7A2P2O60397 106 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 ORM2P19652 201 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 CXCL3P19876 107 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 OR2F1Q13607 317 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 ATP5SQ99766 215 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 RNF126Q9BV68 326 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 NRN1Q9NPD7 142 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 MBD2Q9UBB5 411 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 SORL1Q92673 2214 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 GLMPQ8WWB7 406 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 AQP10Q96PS8 301 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 ARL6Q9H0F7 186 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 ZNF98A6NK75 572 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 H0YIZ8 118 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 TAAR5O14804 337 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 OR5G3P0C626 314 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 FGF7P21781 194 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 NHLH2Q02577 135 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 ARL16Q0P5N6 197 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 Q8N1Y9 231 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 STXBP6Q8NFX7 210 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 UBE2CO00762 179 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 CCNKO75909 580 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 CXCL2P19875 107 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 APOC4P55056 127 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 B2MP61769 119 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 PRR20EP86478 221 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 PRR20CP86479 221 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 PRR20DP86480 221 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 PRR20BP86481 221 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 PRR20AP86496 221 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 OPCMLQ14982 345 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 GUK1Q16774 197 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 MGST2Q99735 147 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 ARV1Q9H2C2 271 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 ZMAT4Q9H898 229 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf16-202ENST00000486420 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 H3BRN7 92 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 K7EQG2 157 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 ISLRO14498 428 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 PSMB3P49720 205 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 CLINT1Q14677 625 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf16-202ENST00000486420 MBP02144 154 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms