RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 MFFQ9GZY8 342 aa8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.61□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 PFDN1O60925 122 aa8.61□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 IGLC1P0CG04 106 aa8.61□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 ADMP35318 185 aa8.61□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 GUCA2BQ16661 112 aa8.61□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 Q6ZWC4 215 aa8.61□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.61□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 AQP10Q96PS8 301 aa8.61□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.61□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.61□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.61□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 MLXQ9UH92 298 aa8.61□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF320A2RRD8 509 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 HMSDA8MTL9 139 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 DFFBO76075 338 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 YIF1AO95070 293 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 IFNA5P01569 189 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 C1QBP02746 253 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 FABP1P07148 127 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 EDN2P20800 178 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 RAB31Q13636 194 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 TEPPQ6URK8 271 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 THAP8Q8NA92 274 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 Q8WTZ3 238 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 TRGV9Q99603 122 aa8.6□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.59□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 UBE2CO00762 179 aa8.59□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 IGKV1-17P01599 117 aa8.59□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 RD3LP0DJH9 198 aa8.59□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 CD300CQ08708 224 aa8.59□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 OR2F1Q13607 317 aa8.59□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 ZFP69Q49AA0 526 aa8.59□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.59□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 HYLS1Q96M11 299 aa8.59□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 ATP5SQ99766 215 aa8.59□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.59□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 FBXL17Q9UF56 701 aa8.59□□□□□ -1.03
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GARNL3-217ENST00000481875 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.58□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 A0A0D9SG52 128 aa8.58□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.58□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.58□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 VWC2Q2TAL6 325 aa8.58□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 TM4SF20Q53R12 229 aa8.58□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 LCE2CQ5TA81 110 aa8.58□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.58□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.58□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.58□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF709Q8N972 641 aa8.58□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.58□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 WFDC1Q9HC57 220 aa8.58□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.58□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.58□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.57□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 TAAR5O14804 337 aa8.57□□□□□ -1.04
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GARNL3-217ENST00000481875 ZNF266Q14584 549 aa8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 K7EMT4 169 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 CXCL2P19875 107 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 APOC4P55056 127 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-217ENST00000481875 LYZP61626 148 aa8.56□□□□□ -1.04
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