RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 C1QL4Q86Z23 238 aa4.96□□□□□ -1.61
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.96□□□□□ -1.61
PRKCI-202ENST00000476635 Q8WTZ3 238 aa4.96□□□□□ -1.61
PRKCI-202ENST00000476635 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.61
PRKCI-202ENST00000476635 PAXXQ9BUH6 204 aa4.96□□□□□ -1.61
PRKCI-202ENST00000476635 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.96□□□□□ -1.61
PRKCI-202ENST00000476635 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.96□□□□□ -1.61
PRKCI-202ENST00000476635 GNG13Q9P2W3 67 aa4.96□□□□□ -1.61
PRKCI-202ENST00000476635 H3BQ15 152 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 SOCS3O14543 225 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 IGLV2-8P01709 118 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 DEFA4P12838 97 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 HILS1P60008 231 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 SOHLH1Q5JUK2 328 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 SAMD13Q5VXD3 122 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 MLST8Q9BVC4 326 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 BUB3O43684 328 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 PAGE4O60829 102 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 GCGP01275 180 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 GLMPQ8WWB7 406 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 ISOC2Q96AB3 205 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 CHRDL1Q9BU40 450 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 PARLQ9H300 379 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF492Q9P255 531 aa4.96□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF98A6NK75 572 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 G3V318 75 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 BMPR1BO00238 502 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 GNG7O60262 68 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 OR2J3O76001 311 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 OR5AU1Q8NGC0 362 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 RXFP4Q8TDU9 374 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 UHRF2Q96PU4 802 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 ELOVL1Q9BW60 279 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF586Q9NXT0 402 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 CACNA1BQ00975 2339 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 A8MTW9 85 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 LTAP01374 205 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 IGLV2-11P01706 119 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 TYMSP04818 313 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 PSG9Q00887 426 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 FHL3Q13643 280 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 TOMM20LQ6UXN7 152 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM219Q86XT9 240 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 FMC1Q96HJ9 113 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM231Q9H6L2 316 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 PPP1R2P9O14990 202 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 HNF1AP20823 631 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 ATP5G3P48201 142 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 BLCAPP62952 87 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 AWAT1Q58HT5 328 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 CT83Q5H943 113 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 Q6ZS46 218 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 LINC01551Q86U37 167 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 GATD1Q8NB37 220 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 C4orf3Q8WVX3 66 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 RABAC1Q9UI14 185 aa4.95□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 COLCA2A8K830 154 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 SPTA1P02549 2419 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 ZFHX3Q15911 3703 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 PHOX2AO14813 284 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 RPL7P18124 248 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 SRP14P37108 136 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 TEX38Q6PEX7 206 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 OR5T1Q8NG75 326 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 BTF3L4Q96K17 158 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 SLC50A1Q9BRV3 221 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 ATG101Q9BSB4 218 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 C7orf77A4D0Y5 90 aa4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 GGCTO75223 188 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PRKCI-202ENST00000476635 NBEAP1P0C6P0 100 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms