RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462421.1

DDX39B-216, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-216ENST00000462421 GOSR2O14653 212 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 TSC22D2O75157 780 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 PITX3O75364 302 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 OR5G3P0C626 314 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 TAS2R30P59541 319 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 HBG1P69891 147 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 HBG2P69892 147 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 PMS2P11Q13670 270 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 XP32Q5T750 250 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF546Q86UE3 836 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 SMIM8Q96KF7 97 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 C16orf92Q96LL3 132 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 K7EQG2 157 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 PRAF2O60831 178 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 HYPMO75409 117 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 PET100P0DJ07 73 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF90Q03938 601 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 FGL1Q08830 312 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 TEPPQ6URK8 271 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 Q6ZRG5 221 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 OR11H2Q8NH07 326 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 RNF183Q96D59 192 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 RPRMQ9NS64 109 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 A0A0J9YWU9 116 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 BUB3O43684 328 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 SSNA1O43805 119 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 COX7A2P2O60397 106 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 PSMB3P49720 205 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 DLK1P80370 383 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 ID3Q02535 119 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 ASAH1Q13510 395 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 THAP8Q8NA92 274 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 GLMPQ8WWB7 406 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 C2orf50Q96LR7 162 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 GGACTQ9BVM4 153 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 DOK5Q9P104 306 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 KNCNA6PVL3 124 aa6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 FNDC10F2Z333 226 aa6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 CCSO14618 274 aa6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 UPK1BO75841 260 aa6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 LINC00869P0C866 280 aa6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 ISLRO14498 428 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 S100A11P31949 105 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 BTCP35070 178 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 BAXQ07812 192 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF124Q15973 351 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF709Q8N972 641 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 DCANP1Q8TF63 244 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 PFDN5Q99471 154 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 U3KQE9 123 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF98A6NK75 572 aa6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 K7EPK0 472 aa6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 PLA2G10O15496 165 aa6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 AMBPP02760 352 aa6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 MIFP14174 115 aa6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-216ENST00000462421 ATP6V1FQ16864 119 aa6.6□□□□□ -1.35
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