RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 CLDN34H7C241 214 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 PRCDQ00LT1 54 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 DEFB136Q30KP8 78 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 BTNL8Q6UX41 500 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 UHRF2Q96PU4 802 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 ODF3BA8MYP8 253 aa7.36□□□□□ -1.23
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DDX39B-215ENST00000462256 ZNF735P0CB33 412 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 Q8N9W7 124 aa7.36□□□□□ -1.23
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DDX39B-215ENST00000462256 ZMAT4Q9H898 229 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 IGHG2P01859 326 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 CT45A10P0DMU9 189 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 CD28P10747 220 aa7.36□□□□□ -1.23
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DDX39B-215ENST00000462256 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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DDX39B-215ENST00000462256 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 TREML4Q6UXN2 200 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 CFHR4Q92496 578 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 CSTL1Q9H114 145 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF727A8MUV8 499 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 H3BUA1 57 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 NDUFA7O95182 113 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 AREGP15514 252 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 PAX5Q02548 391 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM187Q14656 261 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 STHQ8IWL8 128 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 BLNKQ8WV28 456 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 KALRNO60229 2985 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 CXCL1P09341 107 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF738Q8NE65 137 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 DDB2Q92466 427 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 A4D1N5 150 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 STAG3L2P0CL84 134 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.237e-10■■□□□ 12.7
DDX39B-215ENST00000462256 YPEL4Q96NS1 127 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV3-20P01619 116 aa7.34□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 TRGC1P0CF51 173 aa7.34□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 FAM78BQ5VT40 261 aa7.34□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 FBXL17Q9UF56 701 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 COL6A5A8TX70 2615 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 OR11H12B2RN74 326 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 TAAR5O14804 337 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 CRYBA4P53673 196 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 UBE2G1P62253 170 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 GUK1Q16774 197 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 C5orf30Q96GV9 206 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 SMIM8Q96KF7 97 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ITPR1Q14643 2758 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 UMAD1C9J7I0 102 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 JTBO76095 146 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 TCF24Q7RTU0 167 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 OR10J4P0C629 311 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ERVFC1-1P60608 527 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 VAMP3Q15836 100 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 FRZBQ92765 325 aa7.32□□□□□ -1.24
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