RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 LGI3Q8N145 548 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 DTD1Q8TEA8 209 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 AP3S1Q92572 193 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 ABHD1Q96SE0 405 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A22Q9H936 323 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 PRR13Q9NZ81 148 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 DOK5Q9P104 306 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 A0A087WXM4 84 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 DISC1C4P0D8 188 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 M0R2Z0 102 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 ISLRO14498 428 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 SOCS3O14543 225 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 GALR1P47211 349 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 PAX9P55771 341 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 CLINT1Q14677 625 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 C20orf173Q96LM9 149 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 RBKSQ9H477 322 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 U3KQ87 197 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 LYRM9A8MSI8 78 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 PRM2P04554 102 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 MEOX2P50222 304 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 CCL18P55774 89 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 GAMTQ14353 236 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 BAP18Q8IXM2 172 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 OR1S1Q8NH92 325 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 IAPPP10997 89 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 ALDH3B2P48448 385 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 CCR6P51684 374 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 FGL1Q08830 312 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 SMCO1Q147U7 214 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 RSG1Q9BU20 258 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 RGS5O15539 181 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 ATP5G1P05496 136 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 AKAIN1P0CW23 69 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 HTN1P15515 57 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 ATP5G3P48201 142 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 FCN2Q15485 313 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 Q8N1X5 172 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 RNF182Q8N6D2 247 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF738Q8NE65 137 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 AKR1C4P17516 323 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 RAB11AP62491 216 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 RHOBP62745 196 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 AMTNQ6UX39 209 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 SSX7Q7RTT5 188 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 RNF141Q8WVD5 230 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 IL22RA2Q969J5 263 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 LINC01587Q99440 93 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 TRGV9Q99603 122 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 PRRT1Q99946 306 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 GPR132Q9UNW8 380 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-211ENST00000449757 HERC1Q15751 4861 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0B4J2A0 478 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF98A6NK75 572 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 ANXA3P12429 323 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 ORM2P19652 201 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 B2MP61769 119 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 DLK1P80370 383 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 AKR1C1Q04828 323 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms